Çukurova bölgesinde bazı kültür bitkilerinde sorun olan alternaria türlerinin izolasyonları, morfolojik ve moleküler karakterizasyonları

Çukurova Bölgesi'nde yetiştiriciliği yapılan bazı kültür bitkilerinde meyve çürüklüğü ve kahverengi lekelere, yapraklarda ise konsantrik halkalar şeklinde genişleyen koyu siyah ve kahverengi lekelere neden olan Alternaria türlerinin karakterizasyonlarını belirlemek amacı ile 2010-2012 yılları arasında farklı bölgelerden Alternaria ile infekteli olduğundan şüphe edilen bitki örnekleri toplanmıştır. Biber, domates, patlıcan, hıyar, turunçgil ve nar bitkilerinin infekteli dokularından Alternaria izolatları in vitro koşullarında 100 mg/l streptomisin içeren PDA ortamı üzerinde saflaştırılmıştır. Alternaria izolatları PDA besi ortamında alt kültüre alınarak zeytuni yeşil, grimsi miselli koloni gelişimleri göstermiş ve mikroskobik yapıları incelenmiştir. Alternaria spp. izolatlarının sıvı kültür filtratı toksinleri in vitro koşullarında farklı bitki yapraklarında testlenmiş ve en şiddetli toksin etkisi, sırasıyla domates ve Fremont meyvelerinden saflaştırılan A. solani ve A. alternata f.sp. citri izolatlarında gözlenmiştir. Toksine karşı en duyarlı konukçu bitki ise patlıcan yaprağı olmuştur. Alternaria izolatlarının genomik DNA'larından rDNA'ya ait ITS/5.8S bölgelerinin DNA fragmenti PCR ile yaklaşık 620 bç büyüklüğünde çoğaltılmış ve MspI ve HaeIII restriksiyon endonükleaz enzimi ile kesilerek tüm izolatlarda iki farklı uzunlukta (480 ve 140 bç) DNA polimorfizmi elde edilmiştir. ITS/5.8S dizi analizleri izolatlar arasında % 98 ve % 99 oranında homoloji göstermiştir.Anahtar Kelimeler: Alternaria spp., ITS/5.8S, PCR, RFLP, Toksin