Irak, Ramadi popülasyonunda moleküler RAPD teknikleri kullanılarak Salmonella typhi'nin genetik değişkenliğinin belirlenmesi

Çalışmamızın temel amacı, Rastgele Arttırılmış Polimorfik DNA (RAPD) PZR tekniğini kullanarak tifo bakteri izolatlarının genetik boyutunu tespit etmek, hangi genetik mutasyonun oluştuğunu veya S. typhi'nin varlığını tespit etmek ve olası kullanım alanlarını belirlemektir. Toplam 50 kişiden alınan kan örneklerinin kültür sonuçları 30'unda S. typhi yönünden pozitif bulunmuştur. Beş ila on gün arasında değişen hastalık döneminde kültür pozitif vaka sayısı %20 (10 örnek) olarak belirlenmiştir. Aynı şekilde, pozitif kan sonuçları %50 (25 örnek) ile en yüksek yüzdeye sahiptir. Hastalığın ikinci döneminde yapılan idrar tahlillerinde pozitiflik oranı %40 (20 örnek) ile ikinci sırada yer almaktadır. OP-E20'de 200-3000 baz çifti arasında değişen 14 bant, OP-L20'de 250-3000 baz çifti arasında 12 bant ve son olarak OP-M14'te 350-2500 baz çifti arasında 16 bant belirlenmiştir. Bu kapsamda OP-E20, OP-L20 ve OP-M14 etkinlik oranları sırasıyla 33,33, 28,57 ve 38,10 olarak belirlenmiştir. OP-E20, OP-L20 ve OP-M14'ün ayırt etme yetenekleri sırasıyla 30.76, 28.21 ve 41.03 olarak belirlenmiştir. Kırsal alanlarda S. typhi sayısı kentsel alanlara göre daha fazladır. Bu bakterilerin enfeksiyonun erken evrelerinde izolasyonu daha sık olup, enfeksiyonun ilerleyen evrelerinde kandan izole edilmektedir. Moleküler tanı, diğer tanı türlerine göre daha uygun bulunmuştur. RAPD reaksiyonlarında primer kullanımının sonuçları, kullanılan farklı primerlere göre ortaya çıkan bantların sayısında ve moleküler ağırlıklarında bir farklılık göstermiştir. Mevcut çalışma, OP-M14 primerinin hepsi farklı olan 16 bant içerdiğinden en verimli olduğunu kanıtlamıştır. OP-M14'ün sırasıyla etkinliği ve ayırt etme yeteneği 38.10 ve 41.03 olarak bulunmuş ve bu oranlar çalışılan primerler arasında en yüksek olanları olarak belirlenmiştir.