Kanser dormansisinde rol oynayan yeni mikroRNA'ların keşfi ve analizi

Kanser tedavisi sonrası nüks, kansere bağlı ölümlerin çoğundan sorumludur. Yayılmış tümör hücreleri, doku ve organlara yıllarca hatta on yıllar boyunca durgunluk benzeri bir durumda yerleşebilir. Bu sessiz hücrelere uyuyan (dormant) hücreler denir. Dormant hücreler, yeniden aktive edildiğinde daha agresif ve tedaviye dirençli tümörler oluşturur. Bu nedenle, kanser dormansisinin incelenmesi, temel bilim ve klinik açıdan çok önemlidir. MikroRNA'lar (miRNA'lar), gen ekspresyonunun düzenlenmesinde önemli roller oynayan kodlanmayan RNA'lardır. miRNA'lar genellikle hedef mRNA'ları olan genin 3' çevrilmemiş bölgesi (UTR) ile etkileşir ve bozulmalarına yol açar veya çevirilerini bloke eder. Dormant kanser hücresi davranışında mikroRNA'ların rolü henüz yeterince anlaşılmamıştır. Laboratuvarımızda, bir Matrigel 3D hücre kültürü sistemi kullanılarak, in vitro kanser dormansi modeli olarak optimize edildi. Bu sistemi kullanarak kanser dormansisinde yeni oyuncuları keşfetmek için miRNA Dizileme (miRSeq), RNA Dizileme (RNA-Seq) ve proteomik analizleri yapıldı. Aktif olarak bölünen kanser hücrelerinin miR-Seq sonuçlarının uykudaki muadilleriyle karşılaştırılması, uyku hali ile ilişkili yeni miRNA'ların bir listesini ortaya çıkardı. Kanser hücre dizilerinde iki yeni dormansi mikroRNA'nın genetik manipülasyonunun bir sonucu olarak, miRNA'ların uyuyan hücre davranışı için önemini gösterdik. Uyuyan fenotipte rol oynayan miRNA'ların doğrudan gen hedefleri keşfedildi. Dormansi ile ilişkili miRNA'ların incelenmesi, kanser dormansinin moleküler yolaklarının daha iyi anlaşılmasını sağlayacak ve yeni tanı, takip ve tedavi stratejilerinin geliştirilmesine katkıda bulunacaktır.