Escherichia coli klinik izolatlarında blaTEM, blaSHV ve blaCTX-M Genlerinin polimeraz zincir reaksiyon yöntemiyle belirlenmesi

Bilinçsiz antibiyotik kullanımı dirençli bakteri prevalansını artırmakta ve tedavi programlarında sorunlar yaşanmasına neden olmaktadır. Direnç gelişimi nedeniyle hasta ölüm oranları artmaktadır. Çoklu ilaç dirençli bakterilerin neden olduğu enfeksiyonlar ekstra sağlık maliyetlerine neden olmaktadır. Escherichia coli (E. coli) Enterobacteriaceae familyasının bir üyesidir. İnsan ve sıcakkanlı hayvanların gastrointestinal sistemlerinde en çok rastlanan önemli patojenlerden birisidir. E. coli infeksiyonlarının en yaygın görülenleri, üropatojenik izolatların neden olduğu idrar yolu infeksiyonları ve enteropatojenik izolatların neden olduğu ishallerdir. Çalışmamızda kullanılan E. coli izolatları Eylül 2018 ile Ocak 2019 tarihleri arasında Trabzon Fatih Devlet Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarından temin edilmiştir. 158 E. coli izolatının 145'i (%92) idrar, 5'i (%3) yara, 3'ü (%2) aspirat, 3'ü (%2) kan ve 2'si (%1) balgam örneklerinden izole edilmiştir. E. coli izolatların tanımlanması ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi için VITEK 2 sistemi kullanılmıştır. Antibiyotik duyarlılık profillerinin değerlendirilmesi Eucast (Eucast Version 9.0) kullanılarak yapılmıştır. E. coli izolatlarının gliserol stokları yapıldı. PZR için kalıp olarak kullanılacak DNA'lar total DNA izolasyonu ile elde edildi. E. coli izolatlarında blaTEM, blaSHV, blaCTX-M1 ve blaCTX-M9 genleri PZR yöntemi ile tarandı ve sonuçlar jel görüntüleme cihazı ile görüntülendi. 158 E. coli izolatının antibiyotik duyarlılık profilleri incelendiğinde en yüksek direnç oranı %99,4 ile ampisilene, en düşük direnç oranının ise %1,3 ile ertapeneme karşı olduğu görüldü. PZR sonuçlarına göre, 65 izolatta (%41,1) blaTEM, 3 izolatta (%1,9) blaSHV, 97 izolatta (%61,4) blaCTX-M1 ve 14 izolatta (%8,9) blaCTX-M9 tespit edildi. TEM+CTX-M1 gen kombinasyonu %26 oranı ile izolatlar arasında en yaygın gen kombinasyondur.