Fasulye (Phaseolus vulgaris L.)'de retrotranspozon genlerinin filogeni analizi

Filogeni analizlerinde, genetik kaynakların tanımlanmasında retrotranspozon moleküler teknikler etkili bir biçimde kullanılmaktadır. Bu çalışmada, Türkiye ve dünyanın farklı orjinlerinden 67 fasulye genotipi LTR-retrotranspozonlara dayalı inter-Primer Binding Site (iPBS) markör tekniği uygulanarak, moleküler düzeyde tanımlanmıştır. iPBS markör analizinde, toplam 47 primerden 180 adet polimorfik bant elde edilmiştir. Bu sonuca göre en yüksek PIC değeri iPBS-2394 primeri kullanıldığında 0.94 olarak, en düşük PIC değeri ise iPBS-2375 primeri kullanıldığında 0.03 olarak elde edilmiştir. STRUCTURE programında populasyon yapısı belirlenmiştir ve ΔK değeri 2 olarak hesaplanmıştır. NTSYS programından elde edilen genetik benzerlik dendrogramı kıyaslandığında paralel sonuçlar gözlemlenmiştir, Grup 1: ağırlıklı olarak Türkiye lokasyonuna ait genotipler, Grup 2: farklı ülkelere ait genotipler ve Grup 3: Hindistan'a ait iki genotiptir. iPBS markör analizinde genotipler arasındaki genetik benzerlik oranının 0.14 ile 0.99 arasında değiştiği görülmüştür. En yakın genotiplerin (15) Bandırma/Türkiye (Sarı şeker) ile (42) Türkiye (Volare) olduğu belirlenmiştir. Aralarındaki benzerlik değerinin 0.99 olduğu görülmektedir ve en uzak genotiplerin (9) Bozdağ/Türkiye (Kula barbunya) ile (52) Hindistan (Dolic hos) olduğu, aralarındaki benzerlik değerlerinin 0.09 olduğu saptanmıştır.