Feline coronavirusun (FCoV) moleküler tekniklerle karşılaştırmalı analizi

Feline coronavirus (FCoV) enfeksiyonu, kedilerde Feline Enfeksiyöz Peritonit (FIP) gibi ölümcül bir hastalığa yol açabilmesi nedeniyle kedi sağlığını tehdit eden önemli bir viral hastalıktır. Bu çalışmada, FIP şüpheli kedilerde FCoV'un tespiti için, özgün olarak tasarlanan bir Ters Transkriptaz Döngü Aracılı İzotermal Amplifikasyon (RT-LAMP) yönteminin tanısal performansının, standart bir nested PCR (nPCR) yöntemiyle karşılaştırmalı olarak değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Bu amaçla, FIP şüpheli 50 adet kediden alınan asites sıvısı (n=25), kan (n=17) ve rektal sürüntü (n=8) örnekleri kullanıldı. Tüm örnekler, referans yöntem olarak kabul edilen nested PCR (nPCR) ve çalışmamızda FCoV S2 gen bölgesini hedef alacak şekilde geliştirilen florimetrik ve kolorimetrik RT-LAMP yöntemleri ile FCoV RNA varlığı yönünden analiz edildi. Analiz edilen 50 örneğin 15'i (%30) nPCR ile pozitif olarak saptanırken, geliştirilen RT-LAMP yöntemiyle 23'ü (%46) pozitif olarak bulundu. RT-LAMP testinin, nPCR ile pozitif bulunan tüm örnekleri tespit etmesinin yanı sıra, nPCR ile negatif bulunan 8 örnekte daha pozitif sonuç verdiği gözlemlendi. Her iki testte de en yüksek pozitiflik oranı asites sıvısı örneklerinde saptandı. Ayrıca, kolorimetrik ve florimetrik RT-LAMP sonuçları arasında tam bir uyum (%100) olduğu gözlemlendi. Bu araştırma sonucunda, geliştirilen RT-LAMP yönteminin, FIP şüpheli örneklerde FCoV RNA'sının saptanmasında standart nPCR yöntemine göre daha yüksek bir saptama oranına sahip olduğu ortaya konulmuştur. Ayrıca, kolorimetrik LAMP'ın pratikliği ve güvenilirliği, bu testin özellikle klinik koşullarda hızlı tanı için önemli bir potansiyel taşıdığını göstermiştir.