Genom boyu ilişkilendirme haritalaması aracılığıyla makarnalık buğdayda su kullanım etkinliği ve kalite özellikleriyle bağlantılı DNA markörlerinin belirlenmesi

Makarnalık buğdayda birden çok genle idare edilen özelliklerin ıslahında geleneksel yöntemler ile moleküler yöntemlerin birlikte kullanılması elzem hale gelmiştir. Bu amaçla geliştirilen son metotlardan olan genom boyu ilişkili haritalama çalışmalarında (GWAS) yüksek genetik çeşitliliğe sahip popülasyon bir kere genotiplenir ve birden fazla özellik için fenotiplenir. Bu çalışmada da 14.255 SilicoDArTve SNP markörüyle genotiplenen 123 makarnalık buğdaydan oluşan popülasyon, 6 farklı çevre koşulunda 3 yıl boyunca arazi denemeleri yürütülerek fenolojik (başaklanma süresi), morfolojik (bitki boyu, bayrak yaprak alanı), fizyolojik, (klorofil indeksi, kanopi sıcaklığı, su kullanım etkinliği, kuraklık hassasiyet indeksi, kuraklık tolerans indeksi), agronomik (bindane ağırlığı) ve kalite (protein oranı, nişasta oranı, yaş gluten oranı, hektolitre ağırlığı, kül içeriği, un rengi, sedimentasyon hacmi) özellikleri için fenotiplenmiştir. GWAS, R'da GAPIT paketinin BLINK modeline göre gerçekleştirilmiştir. Yapılan GWAS sonucunda incelenen özelliklerle ilişkili farklı kromozom bölgelerinde 65 QTL bölgesi belirlenmiştir. Bunlara ilave olarak, kalite odaklı ıslah programları için ebeveyn olabilecek aday makarnalık buğday genotipleri de tanımlanmıştır.