Determination of IDH 1, IDH2, MGMT, TERT, ATRX and H3F3A gene mutations in glial tumors

AMAÇ: Glial tümörler tüm malign beyin tümörlerinin neredeyse yarısını oluşturur En popüler ve tehlikeli primer beyin tümörü türü Glioblastoma Multiforme'dir (GBM). Gbm'nin hayatta kalma oranları çok kısadır ve moleküler belirteçlerle tahmin edilebilir. Çalışmamızın amacı, potansiyel patolojik mutasyonları ve sağkalım üzerindeki etkilerini bulmak için IDH1, IDH2, TERT, MGMT ve ATRX genlerini yeni nesil dizileme ile değerlendirmektir. GEREÇ VE YÖNTEM: Bu çalışma için kraniyotomi yapılan ve yüksek dereceli glioma tanısı alan otuz hasta değerlendirildi. Tüm katılımcılardan periferik kan örnekleri alındı. Örneklerden yeni nesil dizileme ile IDH1, IDH2, TERT, MGMT ve ATRX genleri değerlendirildi. Tüm bu mutasyonların sağkalım üzerindeki etkilerini değerlendirmek için SPSS ile sağkalım analizi yapıldı. BULGULAR: Hastaların ortanca yaşı 58.5 (11-74), %56.7'si (n=17) 60 yaşın altındaydı. Cinsiyete göre erkek hasta oranı %66.7, kadın hasta oranı %33.3 idi. Hastaların yüzde sekseninde IDH, % 83.3 MGMT ve% 70'inde EGFR pozitifliği vardı. Hastalar üzerinde hedeflenen gen dizilimi yapıldıktan sonra 21 mutasyon tespit edildi. Bu mutasyonların üçü IDH 1'de, 2'si IDH2'de, 6'sı TERT'de, 7'si MGMT'de ve 3'ü ATRX'te bulundu. Kadın cinsiyet durumu referans olarak alındığında, kadın cinsiyet durumunun genel sağkalımı 4.63 kat, üçten fazla kromozom anomalisi referans olarak kabul edildiğinde, mevcut verilerden üç veya daha az kromozomdaki anomalinin genel sağkalımı 2.83 kat olumsuz etkilediği belirlenmiştir. BULGULAR: Hedeflenen NGS, hem doğru hem de terapötik olarak anlamlı olan glial tümör kategorizasyonunu mümkün kılarak konvansiyonel histolojiye göre daha iyi prognostik bilgi sağlar. Klinik uygulamada bunun nasıl yapılması gerektiği hala tartışmaya açık olmasına rağmen, bu kanserlerin moleküler belirteçler kullanılarak yeniden sınıflandırılması gerektiğini gösteren kanıtlar vardır. Bununla birlikte, moleküler teşhisin standart bakım rutinimize dahil edilmesinin hastalarımızın sonuçlarını daha iyi anlamamıza yardımcı olacağı açıktır. Anahtar Kelimeler: Next Generation Sequencing, Glioblastoma, Molecular Biology, IDH1/2, MGMT, TERT, ATRX