İdiyopatik pulmoner arteriyel hipertansiyon etiyolojisinde TRPM6 geninde rs2274924 ve rs3750425 polimorfizmlerinin araştırılması

İdiyopatik pulmoner arteriyel hipertansiyon (İPAH) sebebi net bilinmeyen vasküler direncin artmasına bağlı pulmoner hipertansiyon olgusunun bir alt grubudur. Magnezyumun insan vücudunda vasküler yeniden şekillenmede, kan basıncı düzenlenmesinde ve hipertansiyonda aktif rol aldığı gösterilmiştir. Yapılan çalışmalarda Geçici reseptör potansiyel melastatin 6 (TRPM6)'nın iyon kanalının magnezyum (Mg+2) iyonuna duyarlı olduğu, akciğer ve endotel hücrelerde ifade edildiği ve hipomagnezemi ile ilişkili olduğu tespit edilmiştir. Literatür taraması sonucu TRPM6 geninin rs2274924 ve rs3750425 varyantlarının Mg+2 ile ilişkili olduğunu gösteren pek çok çalışma bulunması sebebiyle bu iki varyant seçilmiştir. Bu bağlamda mevcut çalışmada İPAH hastalarında TRPM6 geninin rs2274924 ve rs3750425 varyantlarının ve promoter metilasyon düzeylerinin sağlıklı bir kontrol grubu ile karşılaştırılarak analiz edilmesi amaçlanmıştır. Anahtar kelimeler: Pulmoner hipertansiyon, TRPM6, İPAH, polimorfizm Bu amaç doğrultusunda çalışmamız Fırat Üniversitesi Tıp Fakültesi Kardiyoloji kliniğinden elde ettiğimiz 198 kişilik İPAH tanısı alan hasta grubu ve 198 kişilik sağlıklı kontrol grubu ile yürütülmüştür. Tıbbi Biyoloji bölümü laboratuvarlarımızda hasta ve kontrol grubundan alınan kan örneklerinden DNA izolasyonu yapılarak Real-time PCR Taq –Man genotipleme yöntemi kullanılarak TRPM6 genindeki ilgili polimorfizmler analiz edilmiştir. TRPM6 gen promoter metilasyon analizi DNA'nın bisülfit modifikasyonu sonrası metilasyon spesifik primerlerin varlığında kantitatif qRT-PCR analizi ile saptanmıştır. rs2274924 genotip dağılımları ve allel frekansları açısından gruplar arasında anlamlı bir sonuç görülmemiştir (p>0.05). rs3750425 genotip dağılımları açısından CT heterozigot genotipinin hasta grubunda %40 oranında ve kontrol grubunda %28 oranında görüldüğü ve istatistiki olarak anlamlı düzeyde CT heterozigot genotipinin hasta grubunda attığı belirlenmiştir (p=0.036). Ancak bu anlamlılık düzeyine allel frekansları açısından sınırda bir anlamlılık değeri (p=0.073) elde edilmekle beraber ulaşılamamıştır. Hasta alt grupları genotip dağılımları açısından incelendiğinde rs3750425 alleli için İPAH grubu ile kontrol grubu arasında anlamlı farklılık vardır (p=0.030). Metilasyon analizi sonucunda hasta ve kontrol grupları arasında metilasyon açısından anlamlı bir farklılık elde edilememiştir. Haplotip analizi sonucunda ise rs2274924/rs3750425 haplotipleri açısından genotip bulgularımızı destekler şekilde TT/CT haplotipinin hasta grubunda ciddi oranda arttığı tespit edilmiştir. Mevcut çalışmada TRPM6 geninin rs2274924 polimorfizmi ile İPAH arasındaki ilişkiyi destekleyen kanıt elde edilememesine rağmen, rs3750425 polimorfizmi CT genotipinin İPAH'a yatkınlık açısından bir risk faktörü olabileceğini destekleyen ilk kanıtlar elde edilmiştir. Bu durum belirtilen varyantın İPAH riski açısından Mg+2 alımıyla ilişkili olarak değişebileceğini düşündürmektedir. Bu sonuçları doğrulamak ve TRPM6 geninin rs3750425 varyantının İPAH ve Mg+2 ilişkisi açısından anlaşılması için daha fazla sayıda çalışmaya gereksinim vardır. Anahtar kelimeler: Pulmoner hipertansiyon, TRPM6, İPAH, polimorfizm