Irak'ta düşük yapan bir grup kadında insan sitomegalovirüsü tarafından üretilen mikroRNA'ların moleküler karakterizasyonu

İnsan Sitomegalovirüsü (HCMV), küresel nüfusun büyük bir bölümünü enfekte eden yaygın bir herpesvirüstür. Sağlıklı bireylerde tipik olarak asemptomatik olsa da, bağışıklık sistemi baskılanmış hastalarda ve hamilelik sırasında önemli riskler oluşturur. Hamilelik sırasında İnsan Sitomegalovirüs (HCMV) enfeksiyonu, spontan düşük dahil olmak üzere olumsuz sonuçlara yol açabilir. HCMV'nin plasentayı geçerek fetüsü enfekte ettiği ve potansiyel olarak gelişimsel anormalliklere ve fetal ölüme neden olduğu bilinmektedir. HCMV'nin gebelik sonuçları üzerindeki etkisinin anlaşılması, dikey bulaşmayı önlemeye ve anne ve fetüs sağlığı üzerindeki etkilerini azaltmaya yönelik stratejiler geliştirmek için çok önemlidir. İnsan Sitomegalovirüsü (HCMV) enfeksiyon sırasında viral ve konak gen ekspresyonunun düzenlenmesinde önemli roller oynayan mikroRNA'ları (miRNA'lar) eksprese eder. Bu viral miRNA'lar, viral replikasyonu kolaylaştırmak, konakçı bağışıklık tepkilerinden kaçınmak ve latans oluşturmak için hücresel süreçleri manipüle eder. HCMV miRNA'larının incelenmesi, viral patogenez ve antiviral tedaviler için potansiyel hedefler hakkında bilgi sağlar. Çalışmaya 15/2/2023 tarihinde Bayblon Sağlık Müdürlüğü'ne bağlı Babil Kadın Doğum ve Çocuk Eğitim Hastanesi ve Al-Hashimiya Genel Hastanesi'nin kadın doğum ve jinekoloji bölümlerine başvuran hastalardan kan örnekleri alınarak başlanmıştır. Bu çalışma, düşük yapan 140 kadından HCMV seropozitif olan 50 (%35,7) düşük yapan kadından oluşan bir grup için vaka kontrol çalışması olarak gerçekleştirilmiştir. Düşük yapan kadınlarda CMV antikoru pozitifliği CMV IgM 3(%6,0), hem CMV (IgM hem de IgG) 8(%16,0) ve CMV IgG 39(%78,0) olarak bulunmuştur ve sonuç anlamlıdır. Kırsal alandaki düşük yapan kadınlarda CMV IgM pozitifliği 9(%18), P-değeri (0,0001**) yüksek derecede anlamlı ve Kırsal alandaki düşük yapan kadınlarda CMV IgG pozitifliği 33(%66), P-değeri (0,0001**) yüksek derecede anlamlı bulunmuştur. CMVviral yükü RT-PCR ile ölçülmüştür. (Mir-UL148D, Mir-UL22A-3P, Mir-UL36-3P, Mir-UL36-5P) için rölatif gen ekspresyonu RT-PCR ve Güney Kore'den bu çalışma için özel olarak tasarlanmış primerler ile yapılmıştır. Çalışmamız (hcmv- miR-UL36-5P) için kat değişimi ve eğri altında kalan alanda artış olduğunu ortaya koymuştur, kontrol grubu kat değişimi (1±0,0) ile karşılaştırıldığında kat değişimi (3,11) ve eğri altında kalan alan (0,97±0,32) idi ve sonuç anlamlıydı, ayrıca hcmv-miR-UL36-3P) için kat değişimi (21,16) ve eğri altında kalan alan (0,94±0, 1) kontrol grubuna kıyasla kat değişimi (1±0,0) idi ve sonuç anlamlıydı ve (hcmv- miR-UL22A-3P) kontrol grubuna kıyasla kat değişimi (2,92) ve eğri altında kalan alan (0,94±0, 1) kontrol grubuna kıyasla kat değişimi (1±0,0) olarak bulunmuştur ve (hcmv-mir-UL148D) kontrol grubuna kıyasla kat değişimi (2,66) ve eğri altında kalan alan (0,94±0,4) ile kat değişimi (1±0,0) olarak bulunmuştur. Çalışmamızda, B1-B4 örneklerinin nükleik asit dizilerinin HCMV5'in en homolog referans dizileri (GenBank acc. no. U88704.1) ile hizalanması, bu referans dizilerde bulunmayan dört yeni nükleik asit varyantının (B1'de 155C>T, B3'te 160T>C ve 161T>C ve B4'te 177T>G) varlığını ortaya koymuştur. Bu varyantların çevirisi, 155C>T'nin GP55 kodlu p.59Ser>Phe proteini üzerinde yanlış anlamlı bir etki sergilediğini göstermiştir. Benzer şekilde, hem 160T>C hem de 161T>C, glikoprotein B değişken bölgesi üzerinde p.61Phe>Pro'nun yanlış anlam etkisinin uygulanmasına katkıda bulunmuştur. Üçüncü varyant 177T>G ise kodlanan glikoprotein üzerinde p.65Gly='nin sessiz bir etkisini sergilemiştir. p.59Ser>Phe mutasyonu, 59. pozisyonda polar yüksüz serinin hidrofobik fenilalanine dönüşümünü içerir. Bu değişikliğin proteinin 3D yapısını önemli ölçüde değiştirmesi, katlanma stabilitesini ve konak reseptör ile etkileşimleri etkilemesi beklenmektedir. Benzer şekilde, p.61Phe>Pro mutasyonu, hidrofobik fenilalanini 61. pozisyonda siklik ve sert proline dönüştürerek, genel katlanma ve stabiliteyi potansiyel olarak etkileyen bükülmeler ve kıvrımlar dahil olmak üzere beklenen yapısal değişikliklere yol açar