Karpuz bakteriyel meyve lekesi hastalığı etmeni Acidovorax citrulli'nin moleküler tanısı ve endofitik bakterilerle önlenme olanaklarının araştırılması

Bu tez çalışmasının amacı, Acidovorax citrulli (Ac)'nin neden olduğu karpuz bakteriyel meyve lekesi hastalığına karşı endofitik bakterilerin (EB) etkisinin araştırılması ve Ac'nin moleküler tanısının gerçekleştirilmesidir. Sağlıklı hıyar bitkilerinden izole edilmiş 20 EB izolatı Ac'ye karşı in vivo koşullarda antagonistik aktivite açısından testlenmiştir. Vakum infiltrasyon yöntemiyle Ac ile inokule edilmiş karpuz tohumlarına EB süspansiyonu uygulanmıştır. Bakıroksiklorid ve mancozeb etkili maddeli preparatlar da referans kimyasallar olarak kullanılmıştır. Uygulama görmüş karpuz tohumları büyüme odasında tutulmuş; fide çıkışı ve kotiledon yapraklardaki hastalık belirtilerine göre değerlendirme yapılmıştır. In vivo test sonuçlarına göre; EB izolatlarının % 50'den fazlası pozitif kontrolle karşılaştırıldığında % 64-85 oranında karpuz fidelerinin kotiledonlarında hastalık gelişimini engellemiş ve referans kimyasallardan daha etkili bulunmuştur. Ac'ye karşı in vivo'da başarılı bulunan EB izolatlarının olası in vitro etki mekanizmasının Fe+3 için yarışmaya dayalı olduğu saptanmıştır. Ac'ye etkili bulunan EB izolatları, 16s rRNA primerleri ile yapılan sekans analizi sonucunda; Pseudomonas fluorescens (31 no.lu izolat), P. lutea (53 no.lu izolat), P. putida (61 no.lu izolat), Enterobacter cloaceae (108 no.lu izolat), Chryseobacterium elymi (88 no.lu izolat), Cronobacter sakazakii (15 no.lu izolat) ve Serratia ureilytica (18 no.lu izolat) olarak tanılanmıştır.