Meme kanseri ile ilişkili yeni bir gen MLH3: Genetik ve epigenetik araştırılması

Meme kanseri tüm dünyada kadınlarda en sık görülen kanserdir. Meme kanserine yatkınlık genlerinin saptanması hastalığın ve tedavisinin seyrinin belirlenmesinde büyük önem arz etmektedir. Ayrıca, MLH3 bir DNA yanlış eşleşme tamiri genidir ve bu gende meydana gelen mutasyonların farklı kanser türlerinde zararlı etkilerinin olduğu bildirilmiştir. Bu çalışmanın amacı, ekzom dizileme yöntemi kullanarak daha önce saptanmamış meme kanserine yatkınlık oluşturan varyantları ortaya çıkarmaktır. Ayrıca, meme kanseri hastalarında, meme kanserine yatkınlık geni olabilecek MLH3 geninin ekspresyonu ve metilasyonu araştırılmıştır. Zheen Uluslararası Hastanesine (Irak, Erbil) başvuran 40 çift normal ve kanser dokusu örneği olmak üzere toplam 80 örnek toplandı. Mutasyonları tanımlamak için ekzom dizilimi kullanılmıştır. Mutasyonların yapısal özellikleri veya protein fonksiyonu üzerindeki etkisini tahmin etmek için farklı in silico araçlar kullanılmıştır. Meme kanseri hastalarında MLH3 ekspresyonunu değerlendirmek için Real-time PCR kullanılmıştır. MLH3, CHECK2, BRCA1, BRCA2, BLM, TP53, MSH6, NBN ve PTEN22 genlerinde 22 kalıtsal varyant ve PALB2, RAD50 ve RBM10 genlerinde 4 somatik varyant olmak üzere toplamda 26 varyant tanımlanmıştır. Tümör örneklerinde MLH3 geninin ekspresyonunun normal dokulara kıyasla önemli ölçüde azaldığı ortaya konulmuştur. Sonuçlar istatiksel olarak anlamlı çıkmıştır. Azalmış MLH3'ün ekspresyonu, tüm yaş aralıklarında ve tüm meme kanseri türlerinde anlamlıydı. Ayrıca, meme kanseri derecesi II ve III olan hastalarda MLH3 ekspresyonu önemli ölçüde azalmış olduğu bulunmuştur. Tümör dokusundaki genel metilasyon oranları, MLH3 geni için %3 olarak bulunmuş ancak MLH3 promotör metilasyonuna dair bir kanıt saptanamamıştır. Sonuç olarak, MLH3 geninin özellikle meme kanseri derece II ve III'te duyarlılık geni olarak kullanılabilir olduğu ortaya konulmuştur. Anahtar Kelimeler: DNA Onarımı, Ekzom Dizileme, Meme Kanseri, Metilasyon, MLH3,qPCR