Thi-Qar vilayeti hastanelerinde bulaşan Pseudomonas aeruginosa enfeksiyonlarının moleküler çeşitliliği, karakterizasyonu ve antibiyogram profili

Yaygın olarak sağlık hizmeti ilişkili enfeksiyonlar (SHİE) olarak bilinen nozokomiyal enfeksiyonlar, bir hastanede tıbbi bakım alırken edinilen enfeksiyonlardır. SHEİE'ler, personeli etkileyen mesleki enfeksiyonları da içerebilir. Enfeksiyon, bir patojen savunmasız bir hasta konakçıya bulaştığında gerçekleşir. SHEİ'nin etiyolojisi, enfeksiyonun kaynağına veya türüne ve viral, bakteriyel veya mantar olabilen sorumlu patojene göre belirlenir. Bu çalışmada, Thi-Qar Eyaletindeki Thi-Qar Genel Hastanesi'ne başvuran 150 hastanın yanık, apse, yara sürüntüleri ve idrar örnekleri P. aeruginosa tespiti, tiplendirmesi ve antibiyogram profili çalışması için incelenmiştir. 25-3-2022 - 25-5-2022 döneminde Yoğun Bakım Ünitesine (YBÜ) yatırılan 50 hasta ve hastanenin farklı bölümlerinden (Kadın, Erkek, Yanık ve Acil bölümleri) 100 hasta seçilmiştir. Tür seviyesinin doğrulanması için geleneksel bakteriyolojik yöntemler ve Vitek2 kullanılmıştır. Tanımlamayı doğrulamak ve virülans genlerini (LasA, LasB, ToxA ve Oprl) saptamak için moleküler yöntemler (geleneksel PCR ve 16sRNA Dizilimi) kullanılmıştır. Ayrıca P.aerugionsa genomunda spesifik bir sekans hedeflenerek moleküler yöntem (ERIC-PCR) ile de genetik çeşitlilik çalışılmıştır. Genel olarak P.aerugionsa'nın toplam izolasyon oranı 20/150 (%13,3) olmakla beraber, bunların 6/20'si (%12) yoğun bakım ünitesinden ve 14/100 (%14) hastanenin diğer bölümlerinden izole edilmiş olup, istatistiksel olarak fark söz konusu değildir (P> 0.05). Diğer taraftan, istatistiksel olarak anlamlı bir farkla (P<0,05) hastanenin diğer bölümlerine göre en yüksek (%45) izolasyon oranı Yanık bölümünde gerçeklemiştir. Bu çalışma P.aeruginosa enfeksiyonlarının %75'inin çoğunlukla YBÜ ve Yanık bölümlerindeki nozokomiyal enfeksiyonlar ve %25'inin toplum kökenli enfeksiyonlar olduğunu istatistiksel anlamlılıkla açıkça göstermektedir (P>0.05). P.aeruginosa'nın virülans profili ile ilgili olarak, PCR sonuçları tüm suşların en az iki virülans genini barındırdığını ve en yüksek yaygın genin Oprl ve LasA genleri 20/20 (%100) olduğunu ve LasB'nin 12/20 (%60) oranında bulunduğunu ortaya koymuş olup, suşlarının %65'inde ToxA geni bulunmuştur. Toplu olarak, tüm suşlar, virülans genlerinin farklı kombinasyonlarına dayalı olarak üç genotipe ayrılabilir, en yüksek yaygın genotip, 12/20 (%60) olarak tespit edilen çalışılan tüm virülans genlerini (LasB+, LasA+, ToxA+ ve Oprl+) taşıyan suşlardır. Diğer iki genotip (LasB+ ve ToxA+) ve (LasB) sırasıyla 6/20(%30) ve 2/20(%10) olarak tespit edilmiştir. LasB-, LasA+, ToxA- ve Oprl+ genotipi, yoğun bakım ünitesi hariç tüm hastane bölümlerine dağılmıştır. Tüm P.aeruginosa izolatlarının ERIC dizilerinin amplifikasyonu, Yanık, YBÜ, Kadınlar bölümü ve erkekler bölümü izolatlarının aynı ERIC paternini gösterdiğini, ER bölümü izolatının ise benzerlik matrisi 0.785 ile farklı ERIC paternlerinde ayrıldığını ortaya koymuştur. Ayrıca antibiyotik duyarlılığı açısından en yüksek direncin %40'ı geçmemek üzere Amikasin ve Levofloksasin'e, en düşük direncin ise Augmented ve Pprasilin Tozabaktam'a (%20) karşı olduğu bulunmuştur.