Discovery of new drug ıngredients with her2 protein suppressingeffect in breast cancer treatment with molecular modeling methods

Moleküler modelleme, biyolojik sistemlerdeki moleküler etkileşimlerin bilgisayar destekli yöntemlerle incelenmesini sağlayan bir yaklaşımdır. Bu kapsamda moleküler docking, bir ligandın hedef moleküle bağlanma şeklini ve afinitesini öngörürken; moleküler dinamik simülasyonlar, bu etkileşimin zamana bağlı davranışını analiz eder. Her iki yöntem birlikte kullanıldığında, ilaç tasarımı ve biyomoleküler mekanizmaların anlaşılmasına yönelik güçlü ve bütüncül bir değerlendirme sunar. Bu çalışmada, meme kanserinde prognostik ve terapötik önemi bulunan HER2 (erbB‑2) gen ekspresyonunun modülasyonu açısından, krill yağı kaynaklı omega‑3 yağ asitleri EPA ve DHA ligandlarının potansiyel inhibitör etkileri araştırılmıştır. Çalışmanın sonuçları, krill yağı kaynaklı omega‑3 yağ asitlerinin, HER2 aracılı proliferatif sinyalleşmeyi baskılayarak potansiyel hedef‑ödaklı antineoplastik etkiler gösterebileceğini öne sürmektedir. Bu bulgular, moleküler docking ve dinamik simülasyon sonuçlarıyla desteklenerek, yeni HER2 inhibitörlerinin tasarımında DHA ve EPA türevlerinin alternatif ligand adayları olabileceğini ortaya koymaktadır.