Pamuk solgunluk hastalık etmeni Verticillium dahliae'da belirlenen mikoviral dsRNA'nın tanılanması ve virülenslik etkisinin belirlenmesi

Amaç: Bu çalışma Aydın ilinde pamukta saptanan Verticillium dahliae'ya ait dsRNA'nın tanısının yapılması amacıyla ele alınmıştır. Materyal ve Yöntem: Aydın ilinden elde edilen stok olarak bulunan V. dahliae izolatları ve Aydın ilinde pamuk üretiminin yoğun olarak yapıldığı Söke ilçesinden Verticillium solgunluk belirtileri gösterdiği tahmin edilen 76 adet pamuk dal örneğinden 33'nün V. dahliae olduğu belirlenmiştir. V. dahliae izolatlarından dsRNA analizleri Balija vd. (2008)'e göre yapılarak izolatlarda mikoviral dsRNA belirlenmiş ve tek basamaklı RT-PCR yöntemi ile tanısı yapılmıştır. Bulgular: Elde edilen 20 ile 1 kb arasında profil boyutlarında dsRNA'ların tanısında Çin'de V. dahliae enfekteli pamuk bitkisinden izole edilmiş (Feng vd., 2013) Verticillium dahliae partitivirus 1'in NCBI'daki nükleotit dizisi kullanılarak tasarlanan Primer 3 programı ile primer çifti kullanılarak tanılanmıştır. dsRNA içeren ve içermeyen V. dahliae fungal izolatlarının virulenslikleri arasındaki farkların belirlenmesi için gövde enjeksiyon ve kök daldırma yöntemleri sonucu mikoviral dsRNA içeren fungal izolatlardan (650) birisinin dsRNA virülensliğinin en düşük, ikisinin (N34, N40) ise en yüksek olduğu SPSS analizi sonucu ile belirlenmiştir. Pozitif sonuç alınan dsRNA örneklerinden agar jel elektroforezde en net bant profili veren ve patojenisite denemesinde en iyi sonuç alınan 5 adet izolalat seçilerek sekans dizi analizi yapılmıştır. Sonuç: Elde edilen dsRNA dizilerinin BLAST ve MEGA analizleri sonucunda Aydın ilinde saptanan dsRNA örneklerinin Feng vd. (2013) ve Canizares vd. (2015)'in çalışmalarındaki Verticillium dahliae partitivirus 1 ve Verticillium dahliae partitivirus ol-1 olarak isimlendirilen mikovirüslere ortalama %94 ile 98 oranlarında benzer olduğu tespit edilmiştir. Anahtar Kelimeler: sRNA, Mikovirüs, Patojenisite, RT-PCR, Sekans, Verticillium dahliae.