Pistacia vera'dan izole edilen aspergillus türlerinin PCR-RFLP analizleri

Pistacia vera L. Batı Asya ve Orta Doğu Bölgelerinde yetişen Anacardiaceae familyasına ait yaprağını döken bir ağaçtır (Woodroof, 1967; Tous & Ferguson, 1996). Antepfıstığı Avrupanın Akdeniz Bölgelerinde, Kuzey Afrika, Orta Doğu, Kalifornia ve Çin'in geniş alanlarında yetişen iki evcikli bir bitki türüdür (Onay vd., 2004). Başlıca antepfıstığı üreten ülkeler İran, Türkiye, Suriye ve Amerka Birleşik Devletleridir (FAO, 2004). Antepfıstığı üretimi Türkiyede çoğunlukla Güneydoğu Anadolu Bölgelerinde Gaziantep, Şanlıurfa ve Siirt yörelerinde geniş bahçelerde yapılmaktadır. Antepfıstığında tespit edilen çoğu hastalıklar önemli hasarlara yol açmaktadır. Antepfıstığı meyvesini enfekte eden fungal hastalıkların en önemlilerinden biri olan Aspergillus sp. ekonomik zarar veren bir cinstir. Aspergillus türleri dünya çapında çeşitli habitatlarda, yiyecekleri çürüten mikotoksinleri üretir, insan ve hayvan patojeni olarak da bilinmektedir. Aspergillusbüyük miktarda Aflotoksin ürettiğinden Orta Doğu ülkelerinde yetiştirilen antepfıstıklarında büyük tehlike oluşturmaktadır. Bu çalışma Türkiyenin farklı klimatik bölgelerinden toplanan antepfıstığı meyvelerinde izole edilen Aspergillus spp.'lerin DNA polimorfizmlerini belirlemek amacıyla yapılmıştır. Toplam 27 Aspergillus türleri izole edilmiş ve PCR çalışmaları Aspergillus türlerini tespit ve teşhis için geliştirilmiştir. ITS, Aktin ve βTubilin gibi markerler nükleer ribozomal dizayn edilmiş spesifik primerler kullanılmıştır. PCR ürünleri RFLP analizlerini çeşitli restriksiyon enzimleri (HindIII, PstI, TaqI ve EcoRI). RFLP analizlerinde Aspergillus izolatlarında, ITS, Aktin ve βTubilin'lerle PCR ve RFLP'da kullanılmıştır. Düşük oranda polimorfizm tespit edilmiştir.