Engineering, production and characterization of RBDand nucleocapsid fusion protein

SARS-CoV-2, Şiddetli Akut Solunum Yolu Enfeksiyonu Coronavirüsü 2, insanda COVID-19 isimli enfeksiyona sebep olan tek zincirli RNA virüsüdür. SARSCoV-2 dünya çapında büyük kayıplara sebep olan COVID-19 pandemisine yol açmıştır. COVID-19 pandemisinin ilk günlerinden itibaren enfeksiyonu önleyici ve iyileştirici tedavilerin geliştirilmesi önem kazanmıştır. SARS-CoV-2'nin hızlıca varyantlaşması ve virüsün tedavilere karşı tepkisinin düşük olması evrensel COVID-19 aşısı konusunu gündeme getirmiştir. SARS-CoV-2'nin spike proteininin RBD alt birimi (Reseptör baglama alanı) konağın ACE2 isimli reseptörünü tanır ve bağlanarak enfeksiyonu başlatır. RBD alt biriminin SARS-CoV-2 varyantları arasında korunması sebebiyle terapötik ajanların geliştirilmesinde öncül olmuştur. Nucleocapsid proteininin spesifik biyokimyasal yapısı ve enfeksiyon sürecindeki rolü ile terapötik protein olarak kullanımı diğer çalışmalardan farklı bir yorum getirmektedir. Rekombinant RBD ve nucleocapsid füzyon proteini, konakta enfeksiyon gelişmeden bağışıklığı tetikleyerek antijen görevi görür. Bu tez çalışmasının amacı, Nicotiana benthamiana bitkilerinde RBD ve nükleokapsid proteinlerinden oluşan bir rekombinant füzyon proteininin üretilmesi ve daha önce laboratuvarımızda üretilen ve karakterize edilen rekombinant RBD ve nükleokapsid proteinlerinden oluşan antijen kokteyli ile fonksiyonel aktivitesinin karşılaştırılmasıdır. Bu amaçla, tasarlanan füzyon proteini bitki ekspresyon vektörü kullanılarak eksprese edilmiş ve üretilen füzyon proteini N. benthamiana bitkisinden saflaştırılmış ve karakterize edilmiştir. Bu yüksek lisans tezi kapsamındaki füzyon proteininin üretimi ve karakterizasyonu laboratuvarımızda halen devam etmektedir. Farelerde antikor titrelerini incelemek için immünojenisite çalışmaları devam etmektedir. İmmünojenisite çalışmaları tamamlandığında, füzyon proteininin kokteyl antijenleri gibi yüksek antikor titrelerini indüklemesi ve SARS-CoV-2'ye karşı aşı araştırmaları için umut verici bir yaklaşım olması beklenmektedir.