Şanlıurfa ilinde yetiştirilen halep keçilerinde TLR2 genindeki polimorfizm ve sütteki somatik hücre sayısı arasındaki ilişkinin araştırılması

Tezin amacı Şanlıurfa ilinde yetiştirilen Halep keçilerinde Toll-benzeri-reseptör 2 (Toll-Like-Receptor 2; TLR2) genindeki polimorfizmin araştırılması ve tespit edilen polimorfizm ile bu keçi ırkından elde edilen sütlerdeki somatik hücre sayısı arasında ilişki olup olmadığının belirlenmesidir. Şanlıurfa ilinde Halep keçisi yetiştiriciliği yapan 5 çiftlikte bulunan 100 halep keçisinden doğumların başlamasından sonra birer aylık arayla iki kez 50 ml süt örneği toplandı. Süt örneklerinin 25 ml'si DNA izolasyonu yapmak amacıyla, diğer 25 ml'si somatik hücre sayısının belirlenmesi amacıyla kullanıldı. TLR2 geninin 442 bç'lik kısmı PCR işlemi ile çoğaltıldıktan sonra PCR ürünleri VspI enzimi ile muamele edildi. Kesim ürünlerinin %2'lik agaroz jel elektroforezinde incelenmesi sonucu GG, GA ve AA şeklinde üç genotip gözlendi. Genotiplenen örneklerden 95'i GG, dördü GA ve biri ise AA genotipine sahip olduğu gözlendi, G allelinin frekansının 0.97, A allelinin frekansı 0.03 olarak hesaplandı. Keçi sütündeki gerçek somatik hücre sayısı bakımından genotip ortalamaları arasındaki fark istatiksel olarak önemsiz bulunurken logaritmik düzeltme sonrasında istatistiksel farkın önemli olduğu ve A allelini taşıyan bireylerin sütlerindeki somatik hücre sayısının daha düşük olduğu bulundu. TLR2 geninin G/A polimorfizminin SCC üzerinde önemli bir etkisi olduğu belirlendi. Yapılan çalışma ile bu ırkta söz konusu polimorfizmin somatik hücre sayısı ile ilişkisinin belirlenmesi durumunda bu polimorfizm somatik hücre sayısı ve mastitis direnci yönünden ıslah çalışmaları amacıyla damızlık seçimi için yapılan seleksiyonda kullanılmak üzere belirteç olarak kullanılabilir.