Birleştirilmiş yapay sinir ağları kullanılarak hemoglobinin ikincil yapısının tahmin edilmesi

öz YÜKSEK LİSANS TEZİ BİRLEŞTİRİLMİŞ YAPAY SİNİR AĞLARI KULLANILARAK HEMOGLOBİNİN İKİNCİL YAPISININ TAHMİN EDİLMESİ îremERSÖZ ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ELEKTRİK-ELEKTRONİK ANA BİLİM DALI Danışman : Yard. Doç. Dr. Turgay İBRİKÇİ Yıl: 2003 Sayfa: 60 Jüri : Yard, Doç. Dr. Turgay İBRİKÇİ Prof. Dr. Seyhan TÜKEL Yard. Doç. Dr. Ulus ÇEVİK Proteinler, hayati önem taşryan görevleri nedeniyle organizmaların en önemli kısımlarıdır. Bu bakımdan, bir organizmanın yaşam sürecini anlayabilmek için ilk olarak, fonksiyonuyla yakından ilgili olan yapısının bilinmesi gerekmektedir. Protein yapılan, Birincil, İkincil, Üçüncül, Dördüncü! olmak üzere dört ana hiyerarşik düzeye sahiptirler. Birincil yapı amino asit dizilimidir. Pohpeptit zincirlerinin bölgesel şekillenmeleri, ikincil yapıyı oluşturur, üçüncül yapı ise son şeklin oluşumunda ikincil yapıların ne şekilde bir araya gelmeleri gerektiğini belirler. Bir veya daha fâzla polipeptit zincir arasındaki etkileşimler de dördüncül yapıyı oluşturur. Yapay sinir ağlan, proteinlerin ikincil yapılarının tahmininde başarıyla kullanılabilen algoritmalardandır. Bu tezde, genel regresyon sinir ağlan (GRNN), probabilistik sinir ağlan (PNN) ve geri yayılan algoritması (BP) hemoglobinin, amino asit dizilişlerinin farklı pencere boyutlan elde edilmiş birincil yapışma uygulanarak ikincil yapısı tahmin edilmeye çalışılmıştır. Daha sonra tüm ağların sonuçlan, GRNN ile birleştirilmiştir. 20 attâ-141 ve 20 beta-146 hemoglobin zincirleri içeren veri seti, Protein Veri Bankasından otoşturulmuştur. GRNN'nin genel basan oranı, beta zincirleri için 90.2- 91.7% ve alfa zincirleri için 85.9-87.3% dir. PNN, beta için 91,2-92%, alfa için 85.4- 86.5% genel başarıya ulaşmıştır. BP'nin genel başarısı ise beta için 89.9-92.5% ve alfa için 86.5-90.3% dir. CNN sonuçlarına göre tahmin başarısında önemli bir artış olmamıştır. Anahtar Kelimeler: Genel Regresyon Sinir Ağlan, Probabilistik Sinir Ağlan, Geri Yayılım Algoritması, BHeştirilmiş Sinir Ağlan, Hemoglobin.