Determination of genetic variations in black mulberry (Morus nigra) genotypes from Türkiye and Iraq

Bu çalışma, Irak ve Türkiye'den 47 Morus nigra genotipinin bu bölgeler içindeki ve arasındaki genetik çeşitliliğini araştırmak amacıyla Simple Sequence Repeat (SSR) markörleri ve Inter Primer Binding Site (IPBS) markörleri kullanılarak yapılmıştır. Araştırma kapsamında Morus nigra genotiplerinin genetik çeşitliliğinin tespiti için IPBS markör sistemleri ilk kez kullanılmıştır. Irak ve Türkiye'den toplam 47 Morus nigra örneği, 10 SSR belirteci kullanılarak analiz edilmiş ve PIC (Polimorfik Bilgi İçeriği) değeri 0.51 ile 0.68 arasında değişen bir polimorfizm ortaya çıkarılmıştır. Çalışmada elde edilen alel sayısı 27 olup, alellerin ortalama polimorfizm oranı %75'tir. IPBS analizi, 0.26 ile 0.50 arasında değişen bir PIC değeri ile sonuçlanmıştır. Elde edilen toplam bant sayısı 138'dir ve bunların 108'i polimorfiktir. Polimorfik bantların yüzdesi %74 olarak bulunmuştur. Elde edilen veriler, genetik çeşitlilik endeksleri ve Temel Koordinat Analizi (PCoA) dahil olmak üzere çeşitli istatistiksel analizlere tabi tutulmuştur. Sonuçlar, Morus nigra genotiplerinin SSR lokuslarında düşük varyasyonlara sahip olduğunu göstermektedir. Ancak IPBS markör sistemi, retrotranspozonların güçlü bir şekilde kullanıldığını gösteren oldukça yüksek varyasyonların belirlenmesini sağlamıştır.