Zerene kaplıcasından (Hakkari) izole edilen bakterilerin ekstraselüler hidrolitik enzim kapasitelerinin belirlenmesi ve karakterizasyonu

Bu araştırmanın materyalini; Hakkari İli'nin Sarıtaş Köyü sınırları içerisinde yer alan Zerene Kaplıcası'nda toplanan su ve sediment numuneleri oluşturdu. Su ve sediment numunesinden izole edilen 4 bakterinin amilaz, lipaz, selülaz, proteaz, ksilanaz, L-asparaginaz ve L- glutaminaz üretme kabiliyetlerine bakıldı. İzolatların tümünün lipaz, ksilanaz, selülaz ve L-glutaminaz enzimi yönünden negatif olduğu tespit edildi. Amilaz enzimini MN001ve MN010, proteaz enzimini MN003, MN004 ve MN010 izolatlar üretme kabiliyeti gösterdi. L-asparaginaz enzimini ise tüm izolatların ürettiği belirlendi. İzolatlar morfolojik, fizyolojik, biyokimyasal özelliklerine ve 16S rRNA dizi analizine göre teşhis edildi. İzolatların genomik DNA'sı izole edildikten sonra 16S rRNA gen bölgesinin PCR amplifikasyonu, 27F ve 1492R evrensel primerleri ile gerçekleştirildi. Türler arasındaki genetik uzaklığı belirlemek için Maksimum Likelihood filogenetik ağacı oluşturuldu. İzolatların filogenetik ağaçta güçlü bir homoloji ile kümelendiği gözlemlenmiş olup genetik pozisyonları ortaya konuldu. Karşılaştırmalı 16S rRNA gen dizisi analizi sonucunda MN001 nolu izolatın %99,59 Bacillus licheniformis ile, MN003 nolu izolatın %100 Bacillus oceanisediminis ile, MN004 nolu izolatın %100 Bacillus subtilis ile, MN010 nolu izolatın %100 Bacillus halotolerans ile benzerlik gösterdiği tespit edildi.