Topraktan izole edilen Bacillus cinsi bakterilerin bazı metabolik özelliklerinin belirlenmesi, plazmid DNA ve protein profillerinin incelenmesi

Araştırmada, Bacillus brevis, Bacillus sphaericus, Bacillus cereus, Bacillus megaterium, Bacillus circulans, Bacillus subtilis, Bacillus licheniformis ve Bacillus coagulans türlerine ait toplam 32 adet suş kullanılmıştır. Suşların 29 adedi topraktan izole edilmiştir. İzole edilen bu suşlar, çeşitli fizyolojik ve biyokimyasal testlere tabi tutularak tanımlanmışlardır. Bakterilerin toplam hücre protein profillerinin sodyum dodesil sülfat poliakrilamid jel elektroforezi (SDS-PAGE) ile analizi yapılmış ve bunların molekül ağırlıkları 19-160 kD arasında bulunmuştur. SDS-PAGE analizi, aynı türe ait suşların protein profillerinin birbirine benzer ve diğer türlerden farklı olduğunu göstermiştir. Bacillus'lurın poli-p-hidroksibütirat (PHB) üretimleri spektrofotometrik olarak belirlenmiş ve PHB üretimlerinin hücre kuru ağırlığına göre %1,06-%41,67 arasında değiştiği bulunmuştur. En yüksek PHB üretimi gösteren Bacillus brevis M6 (%41,67) susunun farklı karbon, fosfat ve azot kaynakları ile azot ve oksijen sınırlaması gibi şartlar altında PHB üretimi araştırılmıştır. Susun en yüksek PHB verimlerine, karbon kaynağı olarak sitrat içeren besi ortamında (%51,85) ve azot kaynağı olarak sodyum nitrat içeren besiortamında (%60,00) ulaştığı; fosfatlı besiortamındaki en yüksek PHB'ın ise %6,50 olduğu tespitedilmiştir. Azotsuz ve oksijeni sınırlandırılmış besiortamlarındaki PHB üretiminin sırası ile %25,45 ve %7,53 olduğu bulunmuştur. Çalışmada, şeker pancarı melası kullanılarak PHB'ın ekonomik eldesi araştırılmış ve farklı melas konsantrasyonlarının PHB üretimine etkisi incelenmiştir. Bu amaçla, glukoz ve sükroz şeker çeşitlerini kullanabilen ve ikinci derecede en yüksek PHB üreten Bacillus cereus M5 suşu seçilerek, %1- %5 melas konsantrasyonlarında^ PHB üretimi incelenmiştir. Bakterinin en yüksek PHB üretimi olan %73,84 değerine, %1 melas konsantrasyonunda ulaştığı tespit edilmiştir. Melas konsantrasyonundaki artışa bağlı olarak bakterinin PHB veriminde azalma olduğu gözlenmiştir. Araştırmada, Bacillus cinsi bakterilerin bazı patojen ve kontaminant test bakterileri üzerindeki genel inhibisyon etkileri agar difüzyon metodu ile incelenmiştir. B. brevis M6'nın, test bakterilerinden olan Staphylococcus aureus ATCC 25923 ve Bacillus thuringiensis RSKK 380 üzerinde; B. cereus M15'in, Pseudomonas fluorescens RSKK 240, Micrococcus flavus ve Bacillus thuringiensis RSKK 380 üzerinde; B. cereus MlO'un, Bacillus megaterium RSKK 578, Bacillus thuringiensis RSKK 380 ve Bacillus cereus F2 üzerinde; B. brevis M4 ve B. cereus M5'in ise Bacillus cereus F2 üzerinde genel inhibisyon etkilerinin olduğu gözlenmiştir. Bacillus türleri suşlarının birbirlerine karşı olan inhibisyon etkilerinin incelenmesinde de yine agar difüzyon metodu kullanılmış ve bazı izolatlarm birbirlerine karşı inhibisyonlannm olduğu bulunmuştur. Çalışmada, Bacillus cinsi bakterilerin Skim Milk Agar (SMA) besiortamında proteolitik aktiviteleri incelenmiş ve B. sphaericus M3 ile B. sphaericus ATCC 14577 suşları dışındaki tüm suşlarda proteolitik aktivite gözlenmiştir. Bu suşlarda tespit edilen proteolitik aktivite 1,4-8,1 mm zon çapı arasındadır ve zonlarm ortalaması 4,17 mm olarak hesaplanmıştır. En yüksek proteolitik aktivite zon çapı 8,1 mm ile B. circulans M32 suşunda bulunmuştur.Ill Bacillus suşlarının plazmid DNA incelenmesinde, yalnız 6 adet suşun plazmid DNA içerdiği ve bu plazmidlerin moleküler ağırlıklarının 3,9-31,7 kb arasında olduğu tespit edilmiştir. Bilim Kodu : 216 Anahtar Kelimeler : Bacillus, izolasyon, protein profili, biyoplastik (PHB) üretimi, antimikrobiyal aktivite, proteolitik aktivite, plazmid DNA.