DNA yapısı için bilgi teorisi uygulaması

Bu çalışmada, öncelikle olasılıksal bir sistemde var olan belirsizliğin ölçümünü ifade eden entropi kavramı ve bilgi kavramı tanımlarına yer verilmiştir. Bu iki kavramın özellikleri ve çeşitleri ayrıntılarıyla gösterilmiş, aralarındaki ilişki ve farklılıklara değinilmiştir. Her iki kavram için, NCBI (National Center for Biotechnology Information) internet sitesinden alınan insan genomuna ait DNA yapılarında uygulamalar yapılmıştır.Ökaryot hücrelerin DNA yapılarında bulunan protein kodlayan bölüm (exon) ve kodlamayan bölümlerin (intron) bazları temel alınarak oluşturulan olasılık dağılımlarından hesaplanan Relative Entropy (Kullback-Leibler uzaklığı) ve Bhattacharyya uzaklığı değerleri ile bu iki yapının olasılılık dağılımlarının benzerliği hakkında sonuçlar karşılaştırılarak sunulmuştur. Exon ve intronların ayrıldığı yer olan Splice site bölgesi içinde benzer bir uygulama yapılmış ve bu bölgenin önceden belirlenebilmesi için alternatif bir yol önerilmiştir. Ayrıca, aminoasitlerin bazlarının olasılık dağılımları ile de Entropi, Kullback-Leibler uzaklığı ve Karşılıklı Bilgi (Mutual Information) değerleri hesaplanmış ve yorumlanmıştır.