Beyin tümörlerinde uzun kodlamayan rna' ların fonksiyonlarının araştırılması

Primer beyin tümörleri, çocukluk çağında görülme sıklığı yüksek olup kansere bağlı ölümler arasında yer almaktadır. Uzun kodlamayan RNA' lar (lncRNA), ncRNA' ların yeni bir sınıfıdır. LncRNA' lar, imprinting, epigenetik regülasyon, apoptoz, hücre döngüsü kontrolü, transkripsiyonel ve translasyonel regülasyon, splicing, hücre gelişimi, farklılaşması ve yaşlanması gibi çeşitli biyolojik rollerle ilişkilendirilmiştir. LncRNA' ların hatalı ifade edilenlerinin kanseri de içeren çeşitli hastalıkların progresyonu ve gelişiminde kritik rol oynadığı düşünülmektedir. Bu çalışmada; uzun kodlamayan RNA ekspresyon değişimlerine bağlı olarak farklı beyin tümörü hücre hatlarının moleküler patogenezindeki rolünün belirlenmesi amaçlanmıştır. Bu kapsamda, beyin tümörü hücreleri ve beyin tümörü kök hücre hatlarının; insan lncRNA ve hastalıkla ilişkilendirilmiş insan lncRNA aray plakları ile ekspresyon profilleri belirlenmiştir. Bu amaçla hücre hatlarından U118MG-U87MG; glioblastoma; astrositoma (grade IV), LN18; glioblastoma; glioma (grade IV), Daoy; medullablastom, SW 1088; astrositoma ve insan parental beyin kanseri kök hücresi kullanılmıştır. Kontrol grubu olarak da insan nöronal kök hücre (korteks) ve Normal İnsan Astrosit hücre hatları kullanılmıştır. Total RNA izolasyonu RNeasy Plus Mini Kit ile izole edilmiştir. Reverz transkriptaz prosüdürü LncProfiler cDNA sentez kit kullanılarak cDNA sentezi yapılmıştır. Hastalıkla ilişkilendirilmiş lncRNA ve insan lncRNA ekspresyonları lncRNA ekspresyonları LightCycler ® 480 real-time PCR ile çalışılmıştır. LncRNA genlerinin ekspresyon profilleri kontrol hücreleri ile karşılaştırıldığında anlamlı azalış ya da artış göstermişlerdir. Sonuç olarak; insan lncRNA profilleri ve hastalıkla ilişkilendirilmiş lncRNA aray plakları ile anti-kanser gen ekspresyon değişimleri belirlendi. Bu bulguların tümörogenez sürecinde etkili olabileceği ve beyin tümörü tedavisi için ek bir tedavi protokolü gerçekleştirilebileceğini düşündürmektedir. Anahtar kelimeler: Uzun kodlamayan RNA; Beyin tümörü; Beyin tümörü kök hücre