Cevizin SSR, SNP ve DArT markörleri ile yoğun genetik bağlantı haritasının oluşturulması

Ceviz (Juglans regia L.) dünyada en önemli sert kabuklu meyve türlerinden biridir. Ceviz aynı zamanda ülkemiz için de çok önemli bir meyve türüdür. Uzun gençlik kısırlığı nedeniyle cevizde ıslah programları uzun zaman almaktadır. İşte bu zorluğun üstesinden gelmek için moleküler yöntemlerin kullanılması gerekmektedir. Bu nedenle, bu çalışma cevizin (1) ilk SSR esaslı genetik haritasını oluşturmak, (2) SSR, SNP ve DArT markörlerini kullanarak cevizde yüksek yoğunlukta haritalar elde etmek amaçlamıştır. Genetik haritalama da Chandler x Kaplan-86 F1 populasyonu kulanılmıştır. Toplamda 1,438 adet SSR primer çifti taranmış ve 505 adet açılım gösteren SSR markörü F1 populasyonunda analiz edilmiştir. Chandler genetik haritasında 279 markör haritalanırken, Kaplan-86 genetik haritasında 274 SSR markörü haritalanmıştır. Birleştirilmiş genetik harita 166 adedi ortak markör olmak üzere toplamda 387 adet markör içermiştir. Birleştirilmiş genetik haritanın toplam uzunluğu 1,569.9 cM olmuş ve ortalama LG uzunluğu 98.1 cM olmuştur. Cevizin yüksek yoğunluktaki genetik haritası sekanslama yöntemiyle genotiplendirme metodu kullanılarak mevcut SSR genetik haritasına SNP ve DArT markörlerinin eklenmesiyle elde edilmiştir. Chandler genetik haritası 3,483 markör içerirken, Kaplan-86 genetik haritası ise 4,275 SSR, SNP ve DArT markörü içermiştir. Chandler genetik haritasının toplam uzunluğu 1,248.9 cM iken, Kaplan-86 genetik haritasının toplam uzunluğu 1,826.5 cM olmuştur. Chandler ve Kaplan-86 genetik haritalarında cM başına sırasıyla 3.0 ve 2.4 markör düşmüştür. Chandler genetik haritasında herbir LG ortalama 234.7 markör içerirken, Kaplan-86 genetik haritası 267.2 markör içermiştir. Sonuç olarak, bu çalışma kapsamında cevizde ilk olarak SSR esaslı genetik harita elde edilmiş ve yüksek yoğunlukta genetik haritalar oluşturulmuştur. Bu tez kapsamında elde edien veriler cevizde bundan sonra yapılacak QTL analizleri, ıslah ve genetik çalışmaların altyapısını oluşturacaktır.