MCF-7 meme kanseri hücrelerinin tespiti ve farklı günlerde alan, yarıçap ve çevre gelişimlerinin izlenmesi

Meme kanseri, kadınlarda görülen kanser türleri arasında en yaygın olanıdır. Dünyada, kanserli hücrelere karşı etkili tedavi yöntemlerinin geliştirilmesi için, bu hücrelerin iyi bir şekilde analiz edilmesi gerekmektedir. Yapılan çalışmada, lab-on-a-chip ortamında kültürlenen MCF-7 adı verilen meme kanseri hücreleri üzerinde görüntü işleme teknikleri uygulanarak bu hücrelerin 3 farklı gündeki gelişimleri incelenmiştir. Çalışmada kullanılan spheroiddeki meme kanseri hücrelerinin üç boyutlu görüntüleri mini-Opto tomografi platformu adı verilen optik tabanlı bir görüntüleme cihazıyla elde edilmiştir. Üç boyutlu spheroid yapılarını içeren görüntüler işlenmeden önce ImageJ programı ile iki boyutlu katmanlara ayrılmıştır ve katmanlı görüntüler üç ana işleme tabi tutulmuştur. İlk olarak görüntüler üzerinde ön işleme adımı gerçekleştirilmiştir. Bu işlemle görüntü içerisindeki bozukluklar çeşitli filtreler yardımıyla giderilmiştir ve görüntüler segmentasyon adımına uygun hale getirilmiştir. Segmentasyon adımında ana amaç spheroid yapısı içerisindeki ana tümör kitlelerini görüntü arka planından ayırmaktır. Bunun için eşikleme işlemi, çeşitli morfolojik işlemler ve contour işlemleri uygulanarak ana tümör kitleleri ön plana çıkarılmıştır. Segmentasyondan sonraki adım ise ana tümör kitlelerinin alan, çevre ve yarıçap gibi bazı geometrik özelliklerinden sayısal verilerin elde edildiği "özellik çıkarma" adımıdır. Görüntüler üzerinde uygulanan ana işlemler sonucunda ana tümör kitlelerinin konturları otomatik olarak çizdirilmiştir ve manuel yapılan çizimlerle karşılaştırıldığında başarılı sonuçlar elde edilmiştir. Üç farklı gün için 3 boyutlu kanserli yapıların hacimsel gelişimleri incelendiğinde ana tümör kitlesi ikinci günden dördüncü güne kadar yaklaşık olarak yüzde 121.72 ve dördüncü günden altıncı güne yaklaşık yüzde 85.80 lik bir büyüme göstermiştir. Bu durum ana tümör kitlesinin sürekli bir şekilde büyüme eğiliminde olduğunu göstermektedir. Çalışmada kullanılan MCF-7 meme kanseri hücrelerinden elde edilen veriler kanser hücrelerinin hacimsel gelişimleri ve ilerleyen aşamalarda kanser türünü belirlemede kullanılacak olan sınıflandırma işlemleri için oldukça önemlidir. Yapılan tez çalışmasında görüntüler üzerinde Python programlama dili ve açık kaynak kodlu OpenCV ortamı kullanılarak kanser hücrelerinin erken tespiti ve özelliklerinin iyi bir şekilde analiz edilmesiyle uzmanlara net ve detaylı bilgiler sunmak oldukça önemlidir. Uzmanlara sunulan bu bilgiler erken teşhisle tedavinin başarısını arttırmada, gereksiz biyopsilerden kaçınmada ve uzmanların kanserli görüntüleri yorumlama süresini azaltmada hayati öneme sahiptir.