Hastalardan izole edilen Pseudomonas Aerugınosa'da Mvat, Cupa ve Cupb genleri ile gen ekspresyonu arasındaki ilişki

Bu çalışma, P.aeruginosa klinik izolatlarında CupA, CupB ve MvaT genleri arasındaki ilişkiyi araştırmayı amaçlamıştır. Bağdat'ta Al-Yarmuk Genel Eğitim Hastanesi'nde farklı hastalık, yara, yanık, diyabetik ayak ülseri, idrar yolu enfeksiyonu, keratit, dış kulak iltihabı olan hastalardan toplanan yüz elli numunenin yüz bir tanesi P.aeruginosa kaynaklı olarak teşhis edilmiştir. Katılımcılar çeşitli yaş gruplarından ve cinsiyetlerden seçilmiştir. Toplanan numuneler farklı seçici ve diferansiyel besiyerlerinde kültürlenmiş ve P.aeruginosa'yı tanımlamak için biyokimyasal olarak test edilmiştir. P. aeruginosa'nın tanımlanması API 20E sistemleri kullanılarak doğrulanmış, sonuçlar API20NE testi için duyarlılığın (%80,1) olduğunu göstermiştir. 5 izolat için CupA, CupB ve MvaT genlerinin tespiti için konvansiyonel PCR uygulanmıştır. Bu genlerin varlığı elektroforez ile doğrulanmıştır ve üç gen için agaroz jelde DNA bandının görünümü sonuçlar pozitiftir (%100). Daha sonra CupA, CupB ve MvaT genlerinin pozitif sonuçlarını veren 5 izolatı için dizileme yapılmıştır ve NCBI'ndeki hizalama, P.aeruginosa ile CupA geninin %98, CupB geninin %96 ve MvaT geninin %100 özdeşliğini göstermiştir. Tüm izolatların antibiyotik duyarlılığını değerlendirmek için dokuz antibiyotik kullanılmıştır. Sonuçlar, izolatların çoğunun Levofloksasin (%94), Timinim (%88,1), Gentamisin (%82,1) ve hem Pipracillin hem de Imipenem'e (%80,1) duyarlı olduğunu göstermiştir, ancak izolatlar diğer antimikrobiyaller Augmentin'e (%72,2), Ceftazidime'e (%33,6), Colistin'e (%37,6) ve Siprofloksasin'e (%27,7) karşı dirençli görünmüştür. Levofloksasin'in, P. aeruginosa izolatlarına karşı en etkili antibiyotiği temsil ettiği tespit edilmiştir. Real Time PCR kullanılarak 16 izolat için CupB, MvaT ve RpoD (housekeeping gen) genlerinin gen ekspresyonu yapılmıştır. MvaT geninin en yüksek gen ekspresyon katlama değerine (3,86) sahip olduğu, CupB geni için 0,01 olduğu ve RpoD için 1,02 olduğu belirlenmiştir. Çalışmanın sonucuna göre; biyofilm oluşumunda rol oynayan CupB geni MvaT global regülatör geni tarafından baskılanmış ve buna rağmen bu izolatlar patojenitelerini korumaya devam etmiş ve bazı antibiyotiklere dirençli oldukları tespit edilmiştir.