Kavun gen kaynaklarında kuraklığa tolerans mekanizmasının moleküler ve fizyolojik yöntemlerle araştırılması

Küresel iklim değişikliğiyle birlikte oluşan kuraklık gibi çevresel etmenler son yıllarda kavunda da verimliliği sınırlandırmaktadır. Türkiye'nin konumu ve sahip olunan genetik zenginlik içerisinde kuraklığa toleransı yüksek materyalin bulunması kuvvetle muhtemeldir. Araştırmada, Türkiye'nin değişik yörelerinden toplanan ve yabani türlerin ise yabancı ülkelerden tedarik edildiği, Ç.Ü. Bahçe Bitkileri Bölümüne ait kabakgil genetik kaynak koleksiyonundan, 192 adet kavun genotipi kullanılmıştır. İklim kontrollü seralarda ve iklim odalarında iki farklı tarama yapılmış, kavun genotiplerinin kurağa tolerans seviyeleri belirlenmiş ve kuraklığa en tolerant genotip olarak Kav-248, en hassas genotip olarak da Kav-20 seçilmiştir. Seçilen genotiplerle kurulan denemede, kontrol grubundan ve kuraklık stresi uygulanan gruptan, 0, 4. 8. 12. 24. 48. ve 72. saatlerde yaprak ve kök örnekleri alınmıştır. Çalışmada kullanılacak genotiplere ait örneklenen köklerden ve yapraklardan RNA izolasyonu ve izolasyonu gerçekleştirilen total RNA'lardan mRNA izolasyonu yapılmış ve sonrasında cDNA sentezi gerçekleştirilmiştir. Kuraklık stresi durumunda ifadeleri gerçekleşen genler cDNA-AFLP yöntemiyle tespit edilmiştir. Ön-amplifikasyon sonrasında ise toplam olarak 77 adet AFLP primer kombinasyonu kullanılarak seçici-PCR reaksiyonları gerçekleştirilmiştir. Araştırmamız kapsamında gerçekleştirilen cDNA-AFLP analizleri sonucunda 24 adet DNA bant profilinin DNA dizileme işlemleri yaptırılmıştır. DNA dizilerin BLAST analizleri sonucunda; 10 tane DNA dizisi kavun genomu ile homoloji göstermiştir. Belirlenen genlerin hangi yolaklarda görev aldığını belirlemek amacıyla KEGG veri bankası kullanılarak dört gende ilgili yolaklar tespit edilmiştir. Real time PCR analizleri yapılarak elde edilen verilerin doğrulaması sağlanmıştır