miRNA expression analysis in breast cancer

Meme kanserinde mikroRNA'ların (miRNA) rolüne dikkat çeken bu çalışma, özellikle miR-551a, miR-1238, miR-4534, ve miR-1294'ün rollerini araştırmıştır. 41 hastadan alınan 82 örnek (41 tümör ve 41 normal doku) üzerinde gerçek zamanlı PCR ile miRNA ifade seviyeleri değerlendirilmiş ve miRDB, TargetScan araçlar ile topGO ve EnrichR veritabanları kullanılarak hedef genler ve yolları belirlenmiştir. Elde edilen sonuçlar, miR-1294 ve miR-551a'nın tümör dokularında normal dokulara kıyasla anlamlı derecede düşük olduğunu (p<0.05), miR-4534'ün ise tümör dokularda normal dokulara göre aşırı ifade edildiğini göstermiştir (p<0.05). MiR-1238 seviyelerinde tümör ve normal dokular arasında anlamlı bir fark bulunmadığı için sonraki analizlerden çıkarılmıştır. miR-1294 tümör baskılayıcı olarak Hippo ve p53 sinyal yollarında yer alan BRCC3, MYCL, YOD1 genlerini hedeflemekte, miR-551a da tümör baskılayıcı olarak sfingolipid metabolizması, Notch, MAPK, ve ErbB sinyal yolarında etkili olan ERbB4, MEF2C, CRB2, TMPRSS2 gibi genleri hedeflemektedir. Buna karşılık, miR-4534'ün onkojenik işlev gösterdiği ve iyon taşınımı, glutamaterjik ve kolinergik sinaps sinyal yollarında yer alan SOX6, ADCY1, ESRRG, ZNF142 gibi genleri hedeflediği düşünülmektedir. Sonuç olarak, miR-551a ve miR-1294'ün tümör baskılayıcı fonksiyonlarıyla terapötik uygulamalar için uygun olduğu, miR-4534'ün ise meme kanseri ilerlemesinde onkojenik bir rol oynayarak tanı biyomarkerı olarak daha fazla incelenmeye değer olduğu ortaya çıkmıştır