Mikrobiyal metabolomik üzerine yaklaşımlar

Bu tez çalışması kapsamında, Türkiye'nin deniz kaynaklı en büyük tuzlası olan, İzmir Çamaltı Tuzlasının 6 farklı tuzluluğa sahip havuzlarından alınan tuzlu su örneklerinin fizikokimyasal bileşimleri belirlenmiş, ayrıca mikrobiyal çeşitlilikleri kültür bağımlı ve kültür bağımsız yöntemlerle çalışılmıştır. Çeşitli seçici kültür ortamları hazırlanarak, farklı tuzluluklardaki havuzlarda baskın şekilde görülen ve havuzun metabolik bileşimi açısından önemli rol oynayan ancak zor kültüre edilebilen mikroorganizmalar kültüre edilmeye çalışılmıştır. Yüksek tuzluluklarda Halorubrum cinsine ait 14 izolatın 9 farklı türü, ayrıca 3 farklı Haloarcula, orta ve düşük tuzluluklarda 15 farklı halofilik bakteri türü belirlenmiştir. Yüksek tuzlulukta ve Basitrasin içeren besi yerlerinde geliştirilerek izole edilen ikinci bir kültür çalışması ile; Halorubrum (11 izolat), Haloarcula (5 izolat) ve Haloferax (3 izolat) cinsi arke üyeleri ve bakteri cinslerinden de Salicola, Halovibrio ve Halospina cinsleri izole edilerek stokları hazırlanmıştır. Değişken tuzluluktaki havuz sularında DAPI ile boyanma sonrası sayılarak belirlenen prokaryotik hücre yoğunluğu; (0.7-4.1) x 107 mL-1 aralığında belirlenmiştir. Aynı zamanda çevresel örneklerden ve kültürlerden Gaz Kromatografisi Kütle Spektrometrisi ile metabolomik veriler elde edilmiştir. Tuzla havuz sularında bulunan metabolitleri belirlemeye yönelik yapılan analizler sonrasında tüm tuzluluktaki örneklerde gliserol, organik asitler ve yağ asitleri gibi bileşenler değişken oranlarda belirlenebilmiştir.