Pseudomonas aerugınosa izolatlarında virulans genlerinin polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile tespiti ve yüksek riskli klonların matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyon/iyonizasyon uçuş zamanı kütle spektrometresi yöntemi (MALDI-TOF MS) ile araştırılması
2023
0 görüntülenme
0 i̇ndirme
Danışman: Doç. Dr. Yeliz Tanrıverdi Çaycı
Özet (TR)
GİRİŞ VE AMAÇ: Pseudomonas aeruginosa, nonfermentatif Gram negatif basildir. P. aeruginosa patogenezinde, birçok virülans faktörü rol oynamaktadır. Bu çalışmada P.aeruginosa çoklu ilaç direnci ile birlikte artmış salgın yapma potansiyeli olan yüksek riskli klonları olarak adlandırılan ST111, ST175, ST235, ST253, ST395'in MALDI-TOF MS yöntemi ile erken tespiti ve P. aeruginosa virulans faktörlerinin üretiminde rol alan genlerin PZR ile araştırılması amaçlanmıştır. GEREÇ VE YÖNTEM: Ondokuz Mayıs Üniversitesi Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji laboratuvarına 01.01.2021-07.06.2022 tarihleri arasında çeşitli kliniklerden gönderilen örneklerden izole edilen P. aeruginosa izolatları (n:100) kullanılmıştır. P. aeruginosa izolatlarında, toxA tespiti için uniplex; algD, plcN, lasB, plcH tespiti için multiplex PZR yapılmıştır.Yüksek riskli klonlara özgü piklerin araştırılması, MALDI-TOF MS yöntemiyle, Vitek- MS (Biomeriux, France) kullanılarak yapılmıştır. BULGULAR: PZR işlemi sonuçlarında ToxA %89, LasB %99, PlcH %98, PlcN %100 ve AlgD %100 oranında pozitif olarak saptanmıştır. MALDI-TOF MS ile yüksek riskli klonlarının varlığı değerlendirildiğinde en sık saptanan yüksek riskli klon ST111 (%49) olup bunu, ST253 (%7), ST175 (%6) takip etmektedir. ST235 ile ST395 klonları ise çalışmamızda saptanmamıştır. TARTIŞMA VE SONUÇ: Virulans faktörleri hem yüksek riskli klonlarda hem de diğer suşlarda yüksek oranlarda tespit edilmiş olup, yüksek riskli klonlar ile virulans faktörleri arasında anlamlı bir ilişki tespit edilmemiştir. Bu ilişkiyi değerlendirmek için daha ileri moleküler çalışmaların yapılmasına ihtiyaç olduğu düşünülmektedir. Yüksek riskli klonların erken tespiti ve uygun antimikrobiyal tedavi gibi stratejik tedavi seçeneklerinin geliştirilebilmesi yüksek riskli klonların dünya çapında yayılımını engellemeye yardımcı olacaktır. ANAHTAR KELİMELER: Virulans faktörleri, Yüksek riskli klon, MALDI-TOF MS.
Yazar
Dr. Gülşah Karacan Temür
Bu Yayına Nasıl Atıf Yapılır
Gülşah Karacan Temür (Tıpta Uzmanlık Tezi). Pseudomonas aerugınosa izolatlarında virulans genlerinin polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile tespiti ve yüksek riskli klonların matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyon/iyonizasyon uçuş zamanı kütle spektrometresi yöntemi (MALDI-TOF MS) ile araştırılması, 2023, Ondokuz Mayıs University.
Anahtar Kelimeler
Lisans
Tüm Hakları Saklıdır
Bu eser belirtilen lisans koşulları altında paylaşılmaktadır.
Ondokuz Mayıs University tezlerinden daha fazlası
- Makine öğreniminde sınıflandırma yöntemleri kullanılarak ulaşım kartı suistimalinin tespit edilmesi(2023)
- Domateste erken yaprak yanıklığı hastalığına neden olan alternarıa spp. ne karşı biyolojik mücadele olanaklarının araştırılması(2023)
- Kemik suyu üretiminde farklı pişirme tekniği ve organik asit kullanımının ürün kalitesi üzerine etkisi(2023)
- Birinci basamakta tip 2 diyabet hastalarının ilaç uyumu ve yaşam kalitesi ilişkisi(2023)
- Spor Bilimleri Fakültesi öğrencilerinin liderlik özellikleri ve empati düzeylerinin incelenmesi(2023)
- Astım hastalarına verilen ev egzersiz programının fonksiyonel kapasite ve yaşam kalitesi üzerine etkileri(2023)
