Rizosfer bakterilerinin kavunda Acidovorax citrulli'nin neden olduğu bakteriyel fide yanıklığı hastalığı'na etkisi

Bu tez çalışmasında, Acidovorax citrulli'nin neden olduğu Kavunda Bakteriyel Fide Yanıklığı Hastalığı'nın biyolojik mücadelesinde rizosfer bakterilerinin kullanım olanakları in vitro ve in vivo koşullarda araştırılmıştır. Bu amaç doğrultusunda kavun, karpuz, domates, okaliptüs ve çam rizosferinden alınan toprak örneklerinden 241 adet aday antagonist izole edilmiştir. Rizosfer bakterilerinin yanı sıra farklı patojenlere antagonistik etkileri kanıtlanmış laboratuvarımız koleksiyonunda yer alan 157 adet bakteriyel izolat çalışmaya dahil edilmiştir. Toplam 398 aday antagonist bakterinin, antibakteriyel etkisi ikili kültür testiyle incelenmiş ve 38 bakteriyel izolatın 0.3-7.7 mm inhibisyon zonu oluşturarak antibakteriyel aktiviteye sahip olduğu belirlenmiştir. Bu bakterilerin in vitro antagonistik etki mekanizmaları (siderofor üretme yeteneği, fosforu çözme yeteneği ve indol asetik asit üretme miktarları) incelenmiştir. Bu izolatlardan 15 tanesinin siderofor ürettiği belirlenirken hiçbir izolatın fosforu çözemediği tespit edilmiştir. Öte yandan 11 izolatın ise yüksek miktarda (156.8-170.5 μg/ml) büyüme hormonu olan IAA ürettiği belirlenmiştir. In vitro testler sonucunda antibakteriyel etkisi olan ve birden fazla etki mekanizmasına sahip 8 izolat seçilmiş ve bunların biyolojik tohum uygulamalarıyla hastalık şiddetine etkisi araştırılmıştır. Birinci tohum denemesinde, 8 uygulama hastalık şiddetini %0.48-39.45 oranında baskılamıştır. En başarılı iki izolat ile kurulan ikinci tohum denemesinde ise Y90, %46.37 oranında hastalığı engellerken bu oran Y28'de %18.97 olmuştur. MALDI TOF MS yöntemiyle yürütülen tanı çalışmalarında, Y28 kodlu izolat Providencia rettgeri ve Y90 kodlu izolat ise Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum olarak tanılanmıştır. Bu sonuçlara göre Providencia rettgeri (Y28) ve Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum (Y90) ile yapılacak biyolojik tohum uygulamalarının, kavunlarda Fide Yanıklığı Hastalığı'nın biyokontrolünde başarı getirebileceği sonucuna varılmıştır.