Şadok (Citrus maxima (Burn) Merr.) x (şadok x mandarin (Citrus clementina hort. ex. Tanaka)) geri melez populasyonunda SSR markırları ile genetik haritalama

Turunçgiller dünyada ve Türkiye' de yetiştirici sayısı, üretim alanı, büyüklüğü ve üretim miktarları ile tarımda önemli bir yere sahiptir. Moleküler bitki ıslahında populasyon bireylerinde karakterler arasındaki ilişkilerin tanımlanması, genetik bağlantı gruplarının oluşturulması ve genetik haritalama önemli bir yer tutar. Yapılan bu çalışmada Fransa CIRAD`dan temin edilen Şadok (Citrus maxima (Burn) Merr.) x (Şadok x Mandarin (Citrus clementina hort. ex. Tanaka)) geri melez populasyonu kullanılmıştır. Bu haritalama çalışmasında teknik olarak polimorfizm oranının yüksek olduğu, tekrarlanabilir ve kodominant olan ve diğer tekniklere göre daha fazla bilgi içeren SSR tekniği tercih edilmiştir. Çalışmada toplam olarak 149 adet SSR primeri taranmış olup bunlardan, ebeveynler açısından polimorfik çıkan primerler tüm populasyon bireylerinde kullanılmıştır. SSR analizleri sonucunda elde edilen DNA bant profilleri değerlendirilmiş ve Mendel açılımına uyup uymadığı khi kare analizleri ile test edilmiştir. Mendel açılımına uygun sonuçları içeren SSR verileri JOINMAP 2.0 bilgisayar programı kullanılarak değerlendirilmiştir. Bunun sonucunda, 47 polimorfik SSR primerinden 32 adedi genetik bağlantı haritasını oluşturmak için kullanılmıştır. Harita, markırlar arası mesafenin 8,6 cM olduğu toplamda 293,9 cM uzunluğunda olan 8 bağlantı grubu içermektedir.