Bazı laktonların mitokondriyal ClpP'ye karşı afinitesinin siliko belirlenmesi

ClpP, mitokondriyal matriste bulunan bir serin proteazdır ve yalnızca mitokondride bulunması bakımından benzersizdir. Bu proteaz, yanlış katlanmış veya hasar görmüş proteinleri sindirerek mitokondriyal protein kalite kontrolüne ve normal metabolik aktivitenin korunmasına katkıda bulunur. ClpXP, ATP'ye bağımlı bir açılmaz olan ClpX ve bir peptidaz olarak hem stabil hem de aktif olan bir heptamer halkası olan ClpP'den oluşan multimerik bir komplekstir. ClpXP, hem kan kanserlerinde hem de katı tümörlerde aşırı eksprese edilir ve bir kanser alt kümesinin hayatta kalması için gerekli gibi görünmektedir. Ayrıca, ClpXP ile tedavi edilen bloke edici veya aşırı aktifleştirici kanser hücreleri, azalmış solunum zinciri aktivitesi sergiler ve sonunda ölür. Sonuç olarak, mitokondriyal ClpXP hedeflemesi, kanser tedavisi için umut verici yeni bir yaklaşımı temsil edebilir. Sunulan çalışmada, bazı lakton bileşiklerinin ClpP proteininine karşı afinitesini moleküler modelleme yöntemiyle belirlemeye çalıştık. Proteinin kristal yapısı protein databaseden 6BBA kodu ile indirildi. moleküllerin 3D yapıları PubMed web sayfasından alındı. Molegro Virtual Docker programı kullanılarak elde edilen sonuçlara göre, Trichurusin K ve Trichurusin J -162.107 ve -147.058 MolDock Scorelaı ile proteine karşı en yüksek afiniteye sahiptir. Moleküllerin enzimin aktif bölgesi ile detaylı etkileşim haritaları Discovery Studio 2021 Client programı kullanılarak gösterildi.