Türkiye'deki farklı hipersalin ortamlardaki virüs popülasyonlarının omik teknolojileri ile karakterizasyonu

Bu çalışmada, Ayvalık ve Çamaltı Tuzlasının doygunluğa yakın tuzluluklardaki kristalize havuzlarının viral popülasyonları kültür bağımsız ve kültür bağımlı yöntemler ile değerlendirilmiştir. Ayrıca mikrobiyal popülasyonlar fluoresan in-situ hibridizasyon (FISH) ve shotgun metagenomi ile incelenmiş, Haloquadratum ve Salinibacter gruplarının baskın olduğu ve Dünya'nın farklı bölgelerindeki hipersalin ortamlarda kültüre edilmeyen gruplar ile benzerlik gösteren grupların varlığı saptanmıştır. Viral fraksiyonun elektron mikroskopi analizi sonucu örneklerin baş ve kuyruklu, küresel ve iğsi morfolojideki halovirüsleri içerdiği gözlenmiştir. Viral metagenomun biyoinformatik analizleri sonucunda viral popülasyonun büyük bir kısmının veri tabanlarında bulunmayan yeni viral grupları içerdiği belirlenmiştir. Tanımlanan gruplar arasında ise Halorubrum ve Haloarcula cinslerini enfekte eden virüsler başta olmak üzere, kültüre edilen ve edilmeyen çeşitli halovirüsler ile benzerliklere sahip uzun virüs kontigleri elde edilmiştir. Viral grupların replikasyon, rekombinasyon ve mikrobiyal savunma ilişkili proteinleri taşıdığı fonksiyonel profilinin incelenmesi ile belirlenmiştir. Mikrobiyal ve viral metagenomun karşılaştırmalı analizleri, başta Halorubrum ve Halorubrum enfekte eden virüsler arasında olmak üzere, mikrobiyal ve viral gruplar arasında ortama özel etkileşimler olduğuna işaret etmektedir. Kültür bağımlı çalışmalar sonucu Halorubrum enfekte eden Betapleolipovirus ve Haloferacalesvirus cinslerine ait olan iki virüs morfolojik ve genomik özellikleri bakımından karakterize edilmiştir.