Türkiye Epilobium L. and Chamerion (Rafinesque) Rafinesque ex Holub (Onagraceae) taksonlarının nrDNA its dizilerine dayalı akrabalık ilişkileri

Bu çalışma ile ülkemizde yayılış gösteren 4 Chamerion (Rafinesque) Rafinesque ex Holub.ve 22 Epilobium L. taksonu nrDNA ITS bölgesi nükleotit dizileri incelenerek taksonomik açıdan değerlendirilmiştir. Çalışmada kullanılan bitki materyalleri 2014-2015 yılları arasında taksonların doğal yayılış alanlarından toplanmıştır. Toplanan taksonlara ait herbaryum örnekleri Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi Biyoloji Bölümü Herbaryumunda (RUB) depolanmıştır. Polimeraz Zincir Reaksiyonları (PZR) uygulamaları ile çalışılan taksonların total genomik DNA'ları, herbaryum örneklerinden ya da silika jel içerisinde kurutulmuş olan sağlıklı, olgun ve taze yapraklardan elde edilmiştir. Stok materyallerden DNA'ların elde edilmesinde CTAB yöntemi modifiye edilerek kullanılmıştır. PZR ile elde edilen nrDNA ITS bölgesinin nükleotit dizin analizleri gerçekleştirilmiştir. MEGA versiyon 5.05 programı kullanılarak taksonlar arasındaki akrabalık ilişkilerini gösteren ağaç topolojileri elde edilmiştir. Bu çalışma ile ülkemizde yayılış gösterenChamerion ve Epilobium taksonları moleküler yönden ilk kez değerlendirilmiştir. Çalışılan Chamerion taksonlarının nrDNA ITS bölgelerinin nükleotit uzunluklarının 616 bç olduğu, % G-C içeriğinin 53,4-54,1 arasında değiştiği tespit edilmiştir. Epilobium taksonlarına ait nrDNA ITS bölgelerinin nükleotit uzunluklarının 616-620 bç olduğu, % G-C içeriklerinin 55,3-56,8 arasında değiştiği belirlenmiştir. ITS verilerine göre Chamerion ve Epilobiumcinslerine ait taksonların elde edilen filogenetik ağaçlarda farklı kollarda gruplandıklarını ve dış grup taksonlardan net olarak ayrıldığını ortaya koymaktadır. Yapılan analizler Chamerion ve Epilobium cinslerinin monofiletik olduğu görüşünü desteklemektedir.