Angusiklin antibiyotiklerin doking analizleri yardımıyla MRSA'ya karşı potansiyel ilaç adayı olarak taranması

Metisilin-dirençli Staphylococcus aureus (MRSA), ağırlıklı hastane enfeksiyonlarından kaynak alan önemli bir patojendir. β-laktamlar, aminoglikozitler ve kinolonlar gibi farklı antibiyotiklere direnç geliştirmişlerdir. Bundan dolayı, MRSA enfeksiyonlarına karşı, bunların virulans faktörlerini hedef alan yeni ilaçların keşfine büyük ihtiyaç vardır. Stafiloksantin MRSA'nın bir virulans faktörü olup, bu pigmentin biyosentezinin ilk aşaması dehidroskualen sentaz (CrtM) enzimi tarafından sentezlenmektedir. Bu sebeple, CrtM, virulansı zayıflatmak suretiyle MRSA'ya karşı kullanılabilecek potansiyel bir hedef olabilir. Aktinomisetler; Gram-pozitif, filamentli bakteriler olup, farklı biyolojik aktivitelere sahip sekonder metabolitleri yüksek kapasitede üretirler. Bunlar arasında, polisiklik aromatik bileşikler olan ve tip-II poliketid sentazlar tarafından sentezlenen angusiklin antibiyotikler geniş bir yer kaplamaktadır. Bu çalışma, aktinomisetler tarafından üretilen 157 angusiklin bileşiğinin, AutoDock Vina programı kullanılarak, MRSA CrtM enzimi (PBD ID: 3ACW and 3W7F) üzerine inhibisyon etkisinin değerlendirilmesini kapsamaktadır. Doking analizleri sonucunda, incelenen bileşikler içerisinde; Moromycin A (56), Saquayamycin B (58), Saquayamycin A (145) ve Saprolmycin E (29) bileşiklerinin, enzimin substratı olan farnesyl diphosphate (doking skoru -8.3 kcal/mol) ile kıyaslandığında, CrtM ile iyi etkileşim göstererek, sırasıyla; -14.8, -14.4, -13.7 ve -13.7 kcal/mol gibi yüksek doking skorlarına sahip olduğu tespit edildi. Bununla beraber, kesin sonuçların elde edilmesi için moleküler dinamik simülasyonları ve in vitro deneylerin yapılması gerekmektedir.