Bağdat hastalarında caga ve vaca virülans ve gyra antibiyotik direnç genlerinin varlığına dayalı olarak helicobacter pylori'nin moleküler tespiti

Helicobacter pylori (H. pylori) dünyada çok sayıda insanı enfekte eden gram-negatif bir bakteridir ve insan midesinin epitelini enfekte eder. Bu çalışma Bağdat'ta (Yarmouk Eğitim Hastanesi, Al Kindi Hastanesi, Medical City) yürütülmüş ve 100 hasta dahil edilmiştir. Tüm hastalara uzman doktor tarafından tanı konulmuş ve hasta örnekleri Eylül 2022 ile Şubat 2023 tarihleri arasında toplanmıştır. Toplanan gastrik biyopsi örneklerinden ekstrakte edilen RNA sonucu, ters transkripsiyon polimeraz zincir reaksiyonu kullanılarak cDNA'ya dönüştürülmüştür. cDNA, Gerçek Zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (RT-qPCR) ile gen ekspresyonunu ve bu genlerin gastrointestinal hastalık gelişimi ile ilişkisini değerlendirmek için VagA, CagA virülans ve GyrA antibiyotik direnç genleri için spesifik primer setleri kullanılarak çoğaltılmıştır. 16SrRNA kantifikasyon için referans gen mRNA olarak kullanılmıştır, VagA geni için kat değişikliği sonucu 1,9113 iken VagA gen ekspresyon seviyesinin yukarı regülasyonunu göstermektedir. Öte yandan, CagA geni için kat değişimi sonucu 4.6144 olup gen ekspresyon seviyesinin yukarı regülasyonunu göstermektedir. Ek olarak, GyrA geninin kat değişimi sonucu 4.3664 iken, GyrA gen ekspresyon seviyesinin yukarı regülasyonunu göstermektedir. Genel olarak, sonuçlar VagA, CagA ve GyrA için gen ekspresyon seviyesinin yukarı regülasyonunu ve genler arasında anlamlı bir fark olmadığını göstermiştir (p≤0,05). Mevcut çalışmada, VagA, CagA ve GyrA genleri için gen ifadesi arasındaki fark Tukey testi ile belirlenmiştir. Bu sonuçlar, RT-qPCR'nin insan mide dokusunda H. pylori varlığını ve H. pylori genlerinin ekspresyonunu tespit etmek için hassas ve spesifik bir yöntem olduğunu göstermektedir. Bu yaklaşımla H. pylori gen ekspresyonunun in vivo olarak saptanması, H. pylori enfeksiyonlarının tanısının iyileştirilmesine ve patogenezinin anlaşılmasına katkıda bulunabilir.