Çocukluk çağı B öncül hücreli akut lenfoblastik lösemi'de relaps ilişkili genlerin ekspresyon düzeylerinin tanı anında belirlenmesi

Amaç: Çocukluk çağı öncül B-ALL (pre-B ALL) tanısı alan olguların yaklaşık %85'i tedaviye iyi yanıt vererek remisyona girerken, %15'inde relaps gözlenmekte ve bu nedenle de hastalar kaybedilmektedir. B-ALL'de bazı genlerin ekspresyon düzeylerindeki değişikliklerin tedaviye direnç ve hastaların sağ kalım süreleri ile ilişkili olduğu bulunmuştur. Bu çalışmada, çocukluk çağı pre-B ALL olgularında konvansiyonel sitogenetik ve moleküler sitogenetik yöntemlerle belirlenemeyen relaps ilişkili AURKA, CASP1, GPM6B, NUDT15, S100A8 ve Survivin genlerinin tanı anında ekspresyon düzeylerinde değişiklik olup olmadığının belirlenerek, ekspresyonu değişen gen/genlerin relaps riskinin önceden saptanabilmesi için aday bir biyobelirteç olarak ortaya konabilmesi amaçlanmıştır. Yöntem: Pre-B ALL tanılı 15 çocukluk çağı olgusundan ilk tanı anında alınan kemik iliği ve 5 sağlıklı kemik iliği donörüne ait alınan kemik iliği aspirasyon materyallerinden RNA izolasyonunu takiben cDNA sentezi yapılmıştır. Daha sonra Kantitatif Real Time-PCR (qRT-PCR) yöntemi kullanılarak, AURKA, CASP1, GPM6B, NUDT15, S100A8 ve Survivin genlerinin; "housekeeping" gen olarak ise β-Aktin geninin mRNA ekspresyon seviyeleri araştırılmıştır. qRT-PCR elde edilen bulgular Shapiro-Wilk ve Kolmogorov Smirnov Z testi kullanılarak istatistiksel analiz yapılmıştır. Bulgular: Çalışma sonucunda kontrol grubuna kıyasla AURKA (p<0,05), CASP1 (p<0,05) ve Survivin (p<0,05) genlerinin mRNA ekspresyon düzeylerinde yaygın olarak tercih edilen yöntem olan 2-ΔΔCT analizi ile istatistiksel olarak anlamlı bir artış bulunurken, ΔCT değerleri bakımından sadece Survivin geninde istatistiksel olarak anlamlı bir fark belirlenmiştir. GPM6B, NUDT15 ve S100A8 genlerinde ise mRNA ekspresyon düzeylerinde hem ΔCT değerleri bakımından hem de 2-ΔΔCT analizi ile istatistiksel olarak anlamlı bir fark bulunmamıştır. Sonuç: Çocukluk çağı pre-B ALL olgularında 2-ΔΔCT analizi ile AURKA, CASP1 ve Survivin genlerinin ekspresyon düzeylerinde istatistiksel olarak anlamlı farklılıkların tespit edilmesi relaps riskinin belirlenmesi için bu üç genin tanı anında biyobelirteç olarak kullanılabileceğini düşündürmektedir.