Ramadi popülasyonundan/Irak'tan izole edilen Pseudomonas aeruginosa'nın genetik yapısının RAPD-PCR ile belirlenmesi

Ramadi'deki iki Ramadi Eğitim Hastanesindeki hastalardan toplam 100 örnek alınmıştır. Bu örnekler, hastalıklarının kökenlerine bağlı olarak hastalardan toplanmıştır. İzolatlar yaralardan, kulak enfeksiyonlarından ve idrar yolu enfeksiyonlarından elde edilmiştir. Zenginleştirme, seçici besiyeri ve biyokimyasal testler kullanılarak 75 P. aeruginosa karakterize edilmiş ve tanımlanmıştır. 12 P. aeruginosa izolatının genomik DNA'sı bu çeşitli kaynaklardan ekstrakte edilmiş ve bu genomik DNA örneklerinin konsantrasyonu ve saflığının RAPD-PCR analizi için yeterli olduğu belirlenmiştir. İki primer ile amplifikasyon işlemi 27 bant üretmiş ve bunların 24'ü polimorfiktir ve boyutları 250 ile 1500 bç arasında değişmektedir. 12 P. aeruginosa izolatı arasındaki filogenetik bağlantı dendrogramı 24 polimorfik RAPD markerı kullanılarak oluşturulmuştur, farklı P. aeruginosa izolatları arasındaki genetik mesafe ve küme analizi bir Jaccard benzerlik matrisi kullanılarak tahmin edilmiş ve filogenetik ağaç oluşturmak için UPGMA bilgisayar programı kullanılmıştır. RAPD-PCR bantlama modellerine dayanarak izolatlar iki birincil grup genotipinde kategorize elde edilmiştir. Sonuçlar, RAPD-PCR analizinin P. aeruginosa izolatları arasındaki genetik varyasyonu saptamak için iyi bir epidemiyolojik tarama yöntemi olduğunu göstermiştir.