Yeni nesil sekanslama teknolojisi kullanılarak pistacia türlerinde SSR markörlerin geliştirilmesi ve türlerarası F1 populasyonu kullanılarak genetik haritalama ve QTL analizleri

Antepfıstığı (Pistacia vera L.), dünya sert kabuklu meyve üretimi içerisinde önemli bir yere sahiptir. Pistacia cinsi Anacardiaceae familyasının bir üyesi olup içerisinde on birden fazla tür bulunmaktadır. Antepfıstığının genom yapısını belirlemek için yeni nesil sekanslama teknolojisi kullanılarak P. vera'nın Siirt çeşidinde yaklaşık 40 kat yoğunluklu sekanslama yapılmış ve genomun bütünüyle ilgili bilgiler ortaya çıkarılmıştır. Sekanslama sonucunda toplam 26.77 Gb sekans verilerinin birleştirilmesi ile 27.069 adet dizi N50 = 3.4 kb olacak şekilde elde edilmiştir. Bunlar içerisinden 59.280 SSR motifi elde edilmiş ve 8.67 kb'de bir SSR tekrar dizisine rastlanmıştır. Toplam 206 SSR lokusu Pistacia vera'ya ait 24 adet antepfıstığı çeşidi ve 20 yabani Pistacia genotipini karakterize etmek amacıyla kullanılmıştır. Genetik haritalama çalışması Siirt x Pa-18 (monoik atlantik sakızı) F1 populasyonu kullanılarak yapılmıştır. Gerek bu çalışmada gerekse önce yapılan çalışmalarda geliştirilen SSR markörleri kullanılarak toplamda 388 SSR markörü 15 genetik bağlantı grubunda haritalanmıştır. Harita uzunluğu 1.492 cM ve her bir bağlantı grubuna düşen ortalama markör sayısı 3.7 cM olarak hesaplanmıştır. F1 bitkileri 2015 ve 2016 yıllarında yaprak uzunluğu, yaprak genişliği, yaprakçık çifti sayısı, yaprak rengi ve bir yıllık sürgün rengi bakımından karakterize edilmişlerdir. Yapılan QTL analizleri sonucunda yaprak ve sürgün özellikleri ile bağlantılı 17 adet QTL belirlenmiştir.