Elazığ ve çevre illerin populasyonuna ait 15 STR lokusları için alel frekansları dağılımının incelenmesi

ÖZET Çalışmamızda, Elazığ ve çevre illerin (Malatya, Tunceli, Bingöl, Diyarbakır) popülasyonlarına ait 15 Short Tandem Repeat (STR) lokusları allel frekanslarının dağılımının incelenmesi amaçlanmaktadır. Bu çalışmanın Elazığ ve çevre illere ait popülasyonların gen havuzunun frekansları diğer bölgesel ve yurtdışı gen havuzları frekansları ile genetik değerlendirme kriterleri doğrultusunda benzerlik ve farklılıkların belirlenmesine katkı sağlayacağı düşünülmüştür. Ayrıca belirlecek genotip verilerinin allel dağılım frekansları, kişileri ayırt etme gücü adli bilimlerle ilgili çalışmalarda önemli bir veri kaynağı olacaktır. Bu çalışma Fırat Üniversitesi Tıp Fakültesi Adli Tıp Anabilim Dalı DNA laboratuvarında aralarında akrabalık bağı bulunmayan Elazığ ve Çevre İllerin (Malatya, Tunceli, Bingöl, Diyarbakır) yerli halk popülasyonlarında her ilden 50 birey olmak üzere toplam 250 bireyden alınan biyolojik örnekler üzerinde yapıldı. Alınan örneklerden RTA Kan Kiti ile genomik DNA?lar elde edildi. Elde edilen izole DNA?ların Amp F / STR İdentifiler PCP Amplification Kit (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA) kullanılarak istenilen lokuslara ait gen bölgeleri çoğaltıldı. PCR ürünlerinin ABI 310 sekans cihazında elektroforezleri yapıldı ve GeneMapper Software Version 3.2 programında sonuçlar analiz edildi. Elde edilen sonuçlar PowerStarts v.1.2?de ve Arlequin Software 3.11 programlarında değerlendirildikten sonra gözlenen allel sıklıkları, popülasyonlara ait diğer istatiksel veriler ile popülasyonların kendi aralarındaki genetik uzaklık durumu belirlendi. Türkiye?de 15 STR lokuslarına (D8S1179, D21S11, D7S820, CSF1PO, D3S1358, THO1, D13S317, D16S539, D2S1338, D19S433, vWA, TPOX, D18S51, D5S818, FGA) ait benzer çalışmalar yapılmış olup, Elazığ ve çevre illerini birlikte değerlendiren çalışma yapılmamıştır. Bu çalışmada ayrımlama gücü değerleri; en yüksek Elazığ?da D2S1338 (0,960), Malatya?da D2S1338 (0,953), Bingöl?de D2S1338 (0,964), Tunceli?de D18S51 (0,952) ve Diyarbakır?da D18S51 (0,962) lokuslarında, en düşük ise Elazığ?da TPOX (0,808), Malatya?da CSF1PO (0,829), Bingöl?de TPOX (0,863), Tunceli?de D5S818 (0,833) ve Diyarbakır?da D5S818 (0,817) lokuslarında belirlenmiştir. Ayrıca popülasyonların kendi aralarında ikili gruplar şeklinde değerlendirildiğinde en uzak genetik ilişkinin Elazığ ve Tunceli arasında olduğu görülmüştür. Sonuç olarak, bu çalışmanın 15 STR lokusları allel frekansları elde edilerek, bu veriler ile daha önce yapılan çalışmaların karşılaştırlmasına ve popülasyonların filogenetik ilişkilerinin değerlendirilmesine yarar sağlayacağı düşünülmektedir. Anahtar Kelimeler: Kısa ardışık tekrar dizileri, Allel, Elazığ ve çevre illeri