İdrar yolu enfeksiyonu (İYE) olan hastalardan ve ortamdan izole edilen çoklu ilaçlara dirençli E. coli arasında bazı virülans ve ilaca dirençli genlerin moleküler tespiti

Bu çalışma, çoklu ilaca dirençli (ÇİD) Escherichia coli'nin üriner sistem enfeksiyonu olan hastalarda yayılımını ve çevre örneklerinde etmeni belirlemek amacıyla yapılmıştır. ÇİD E. coli'nin genetik çeşitliliği, bazı antibiyotik direnç genlerinin ve virülans faktörlerinin izolatlar arasındaki dağılımında araştırılmıştır. Toplanan 653 idrar örneğinden 52'sında çoklu ilaca dirençli E. coli saptanmıştır. 26 antibiyotik diski kullanılarak yapılan antibiyotik duyarlılık testine göre su örnekleri arasında 9 MDR-E coli tespit edilmiştir. Tüm izolatlar, seçilen virülans genlerinin ve bazı antibiyotik direnç genlerinin saptanması için bir polimeraz zincir reaksiyonuna (PCR) tabi tutulmuştur. Mutasyonları tespit etmek için seçilen izolatlaraın DNA dizilimi yapılmıştır. Adezyon (FimH ve PapG), kapsül (KpsmII) ve toksinler (HlyA ve Cnf1) gibi virülans faktörlerini kodlayan genleri ve antibiyotik direncinden sorumlu genişletilmiş spektrumlu beta-laktamazları (ESPL'ler) (blaOXA, blaTEM, blaCTX-M, blaSHV) saptamak için PCR uygulanmıştır. Beş fimH ve blaOXA PCR ürünü, Sanger dideoksi dizileme yöntemleriyle dizilenmiştir. Bununla birlikte, sonuçlarımız, izole E. coli arasındaki yaygın ilaç direnci (XDR) ve pan ilaç direnci (PDR) ile karşılaştırıldığında, E coli izolatlarının büyük çoğunluğunun çoklu ilaca dirençli E. coli olarak kabul edildiğini göstermektedir. FimH geni (%100) diğer virülans genleri arasında en yüksek prevalansa sahipken, Cnf1 (%26.9) en düşük prevalansa sahip olmuştur. BlaTEM kodlayan gen (%67,3), blaSHV kodlayan gen (%21,1) ile karşılaştırıldığında en yaygın olanı olmuştur. DNA sıralamasının sonuçları, NCBI GenBank'ta kayıt edilmiştir.