Irak'ın Babylon kentindeki yanıklardan, yaralardan ve idrar yolu enfeksiyonu hastalarından izole edilen pseudomonas aeruginosa'nın moleküler tanımlanması ve virülans analizi

Gram-negatif bir bakteri olan Pseudomonas aeruginosa, antibiyotiklere karşı gösterdiği direnç nedeniyle büyük bir endişe kaynağıdır. Araştırmacılar, efluks pompaları ve antibiyotik hedefleri gibi doğuştan gelen mekanizmalarını ve gen transferi yoluyla edinilen direncini incelemektedir. Bu durum, mikrobiyal ekoloji ve hastalık yönetiminde stratejilere duyulan ihtiyacı vurgulamaktadır. Çalışmamızda, Irak'ın Babil Şehri'ndeki P. aeruginosa'yı araştırmak ve çeşitli genetik yapısı ile patojenite özelliklerineodaklanılmıştır.Araştırma,P.aeruginosa enfeksiyonlarının epidemiyolojisini anlamayı ve hedefe yönelik tedavi stratejileri geliştirmeyi amaçlamaktadır. Örnekler yanıklar, yaralar ve idrar yolu enfeksiyonları olarak ayrılan 100 katılımcıdan ve 50 sağlıklı bireyden oluşan bir kontrol grubu olmak üzere toplam 150 kişiden oluşmaktadır. MİK'i belirlemek için VITEK-2 sistemi kullanılmıştır. Biyofilm üretim oranı, mikrotitre plakası yöntemiyle tahmin edilmiştir. Daha sonra DNA ekstrakte edilmiş, ExoA ve FliC genleri PCR ile çoğaltılmış ve çoğaltılan ürün dizinlenmiştir. Elde edilen diziler daha sonra çeşitli nükleotidleri tespit etmek için NCBI Blast araçları kullanılarak analiz edilmiştir. Pseudomonas aeruginosa kültürünün sonuçları, bakteri kültürünün tipik sonuçlarını göstermiştir. Verilerin analizi, en yüksek P. aeruginosa izolat yüzdesinin (%30) 17-26 yaş grubunda bulunduğunu göstermektedir. 27-36 yaş grubunda %28, 37-45 yaş grubunda %24 ve en düşük yüzde %18 ile 46-51 yaş grubunda bulunmuştur. Ki-kare değeri 1,680 ve buna karşılık gelen p-değeri 0,641'dir. Örneklerin enfeksiyon bölgesine göre dağılımında, en yüksek enfeksiyon bölgesi %42 ile yara izolatlarında oluşurken, bunu %36 ile yanıklar ve %22 ile idrar yolu örnekleri takip etmektedir (ki-kare değeri 3.160 ve p-değeri 0.206). Pozitif örneklerin dağılımı her iki cinsiyet (erkek ve kadın) arasında eşit bir dağılım göstermiştir ve P-değeri 0.631'e eşittir. Kan gruplarına göre dağılım, 50 pozitif izolatın sekiz kan grubu arasında; O+ (%16), O (%12) A+ (%16) A (%10) B+ (%14) B (%12) AB+ (%12) ve AB (%8) olarak dağıldığını göstermektedir. Ki-kare değeri 2.160 olup p-değeri 0.950 gibi yüksek bir değerdir. VITEK-2 sistemi ile elde edilen MİK sonuçları, Gentamisin'e (GEN) %78 oranında duyarlılık ve Aztreonam'a (ATM) %0 oranında en düşük duyarlılık göstererek test edilen suşlar arasında direnç olduğunu ortaya koymuştur. Öte yandan, en yüksek ii direnç %96 ile Meropenem'e (MRP) karşı kaydedilirken, Gentamisin (GEN) %22 oranında direnç göstermiştir. Bu karşılaştırmaya 0.004'e eşit anlamlı bir P-Değeri eşlik etmiştir. Amplifikasyon ve ardından sekanslama ile ilgili sonuçlar, NCBI veri tabanındaki CP075787.1 referans sekansı ile karşılaştırıldığında ExoA geninde farklı varyasyonlar olduğunu göstermiştir. En yüksek varyasyon oranını gösteren izolat aynı zamanda en yüksek biyofilm üretim oranını da göstermiştir. Flic geninin dizi analizi de referans ID'li (L81147.1.) referans diziyle karşılaştırıldığında farklı varyasyonlar göstermiştir. En yüksek varyasyon oranına sahip örnekler yüksek MİK seviyeleri göstermiştir. Bu çalışmanın sonuçlarından, Pseudomonas aeruginosa enfeksiyonunun genç yetişkinlerde yaygın olduğu sonucuna varılabilir. Gentamisin, yüksek duyarlılık oranları nedeniyle çoğu P. aeruginosa izolatının tedavisinde etkilidir. Genetik varyasyonlar biyofilm üretimi ile pozitif korelasyon göstermektedir. ExoA ve FliC gen varyasyonları daha yüksek olan izolatlar daha fazla biyofilm üretmiştir. ExoA ve FliC genlerinin genetik varyasyonları ile MİK arasında pozitif korelasyon vardır. Yüksek antibiyotik direnci gen varyasyonları ile bağlantılıdır.