Kolorektal kanserde macc1-as1 gen mutasyonlarinin moleküler yöntemlerle araştirilmasi

Kolorektal kanser, batıda en sık gözlenen ölüm nedenlerinden biridir. Yakın zaman önce keşfedilmiş MACC1 (metastaz-bağlantılı kolon kanser -1), HGF/Met yolağının anahtar düzenleyicisidir ve kolorektal kanserde yüksek oranda ifade olmaktadır. MACC1 geninin altıncı intronunda MACC1-AS1 karşıt anlamlı RNA bölgesi bulunmaktadır. Bu çalışmada, kodlanmayan MACC1-AS1 RNA?sının ikincil yapısı RNAFold, MACC1 mRNA?sı ile arasındaki sarmal oluşumu ise IntaRNA adlı programlarla analiz edilmiş ve MACC1 gen ifadesinin kontrolünde rol almaya uygun yapısı nedeniyle kolorektal kanserde gözlenen MACC1?in yüksek ifadesi ile ilişkili olabileceği kanısına varılmıştır. Konu ile ilgili açık bir bilgi bulunmamaktadır . Dolayısıyla, bu çalışma MACC1?in kodlanmayan bölgesindeki (MACC1-AS1) olası genomik değişimler ve kolorektal kanser gelişimi arasındaki bağlantıyı araştıran ilk çalışmadır. Bu çalışma 104 kontrol ve 96 kolorektal kanserli bireyin katılımıyla gerçekleştirilmiştir. Kan örneklerinden elde edilen genomik DNA PCR (Polymerase Chain Reaction) yöntemiyle çoğaltılmış ve Tek Zincir Konformasyon Polimorfizmi (SSCP) ile analiz edilmiştir ve kodlanmayan MACC1-AS1 bölgesindeki olası değişiklikleri araştırmak için dizin analizi gerceklestirilmistir. Kontrol ve hasta örneklerinde ekzon 1?de, üç farklı banddan (1, 2, 3) oluşan 6 genotip (1, 2, 3, 1&2, 1&3, 2&3) gözlemlenmiştir. Dizin analizi neticesinde genotip 1?in bir A eklenmesi ve ayrıca GT eklenmesi (rs200028381), genotip 2?nin ise G>A yer değişimi ve A eklenmesi barındırdığı görülmüş; ancak, genotip 3?te bir farklılık bulunamamıştır. Ancak, bu değişimler ve kolorektal kanser arasında anlamlı bir ilişki gözlenememiştir. Bu çalışma moleküler teknikler kullanılarak kolorektal kanserde MACC1-AS1 gen mutasyonlarının araştırıldığı ilk çalışmadır. Ancak kolorektal tümörler ve MACC1-AS1 RNA ifadesi arasındaki bağlantıyı anlayabilmek amacıyla immünohistokimya, Western blotlama ve mRNA ifade analizi gibi ileri analizlere ihtiyaç olduğu görülmüştür.