Plasmodium vivax'ın laktat dehidrogenaz enzimini kodlayan geninin polimeraz zincir reaksiyonu ile izolasyonu ve klonlanması

ÖZET YÜKSEK LİSANS TEZİ Plasmodium vivax'ın LAKTAT DEHIDROGENAZ ENZİMİNİ KODLA YAN GENİNİN POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU İLE İZOLASYONU VE KLONLANMASI Ekrem AKBULUT Fırat Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Biyoloji Anabilim Dalı 2003, Sayfa : 50 Varolan antimalarial lara karşı ilaç direncinin oluşması yeni ilaçların geliştirilmesinin gerekliliğini vurgulamaktadır. Bu amaçla bu tezde Plasmodium vivax Belein soyu (FRANSA) genomik DNA'sından laktat dehidrogenaz enzimini kodlayan gen (/>vLDH) klonlanmış ve dizi analizi yapılmıştır. PvLDH geni günümüze kadar klonlanan ikinci insan malarial laktat dehidrogenaz'ıdır. DNA dizisi, /VLDH'ın Plasmodium falciparum LDH'ı (P/LDH) gibi 316 amino asitlik bir proteini kodlayan 951 bp açık okuma çerçevesini içerdiğini gösterdi. PvLDH'ın P/LDH ve bilinen diğer bazı LDH'lar amino asit dizi kıyaslaması, PvLDH'ın sırası ile PJLDH ile %90,1, Plasmodium berghei LDH'ı ile %90,8, Plasmodium yoelii LDH'\ ile %90,5, insan-M4 LDH'ı ile %26, insan-H4 LDH'ı ile %25 benzer olduğunu gösterdi. Ayrıca PvLDH'ın Glutamat-48 ve Glisin-217 olmak üzere iki tek amino asit delesyonuna sahip olduğu gösterildi. En çok dikkat çeken aktif bölge halkasında 5 amino asit ilavesidir. Önceden P/LDH'dan elde edilen yüksek çözünürlüklü X ışını yapısı bu bölgenin enzim inhibitörleri için cazip bir hedef olabileceğini gösterdi. Anahtar Kelimeler: Sıtma, Plasmodium vivax, Laktat Dehidrogenaz, Polimeraz Zincir Reaksiyonu. VIII