Yeni nesil dizileme teknolojisi ile zeytinin (Olea Europea L. cv. Ayvalık) pedisel dokusunun transkriptom dizilemesi

Zeytin (Olea europea L.) ağacı, Akdenizi simgeleyen bir kültürün parçası olmasının yanı sıra, oluşturduğu meyvesi ve bu meyveden elde edilen yağı ile ekonomik olarak çok değerli bir bitkidir. Bu çalışmada meyve ile ağaç arasındaki bağlantıyı sağlayan pedisel dokusunun gelişiminin moleküler mekanizmasını anlamak, bitkide fotosentez sonucu oluşan metabolitlerin zeytin meyvesine taşınımını sağlayan genetik mekanizmaları ortaya çıkarmak ve absisyon olayında etkili genetik faktörleri belirlemek için ham (Temmuz ayına ait), olgun (Kasım ayına ait) pedisel dokularından total RNA izole edilerek, yeni nesil dizileme teknolojisi Roche 454 GS FLX+ cihazı ile transkriptom dizileme çalışması yapılmıştır. Daha önce zeytinde pedisel dokusuna ait böyle bir çalışma yapılmamıştır. Dizileme sonucunda toplamda 164.733 okuma elde edilmiştir. Bu okumalar birleştirilerek biyoinformatik analizler yapılmış, elde edilen genler sınıflandırılarak tanımlanmıştır