Aydın ilinde sera domateslerinde toprak kaynaklı bakteriyel hastalıkların saptanması

Bu çalışma, Aralık 1999-Şubat 2000 tarihleri arasında Aydın İli ve ilçelerinde örtü altı domates alanlarında Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis, Pseudomonas corrugata ve yumuşak çürüklük grubu Erwinia sp. varlığını saptamak amacıyla yapılmıştır. 2000 yaz dönemi (Şubat?Temmuz)'nde Aydın İlinde incelenen toplam 89 domates serasından toplanan örnekler değerlendirildiğinde herhangi bir bakteriyel patojene rastlanmamıştır. Bu vejetasyonu takip eden güz dönemi (Kasım?Aralık)'nde incelenen toplam 91 domates serasından 8'inde bakteriyel hastalık belirtilerine rastlanmıştır. Bunlardan alınan örneklerden yapılan izolasyon çalışmalarında, Çine ilçesinde 2, İncirliova ilçesinde 1 olmak üzere 3 seradan Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis (Cmm) izole edilmiştir. İzole edilen bakteriler bilinen Cmm kültürü ile karşılaştırıldığında aynı biyokimyasal karakterde olduğu ve domates bitkilerinde (H2274 çeşidi) patojen olduğu saptanmıştır. Domates seralarında yapılan survey çalışmalarımız sonucunda Pseudomonas corrugata ve diğer gövde yumuşak çürüklük grubu bakteriyel hastalıklarına Aydın İli'nde rastlanmamıştır. Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis (Cmm)'nin bilinen 4 yarı seçici besiyerinde (D2an, SCM, mSCM ve KBT) gelişme durumu ve Cmm' in gözle görülebilir koloni oluşturma süreleri ile bu besiyerlerinin domates tohumları ve bitkilerinden izole edilen tanılanmamış diğer bakterilere karşı seçiciliği değerlendirilmiştir. D2an, SCM, mSCM ve KBT besi yerlerinde Cmm'in gelişme oranı nutrient dextrose agar (NDA) kaşılaştırma ortamı dikkate alınarak hesaplandığında sırasıyla %97.3, %20.0, %107.0 ve %64.0 olarak bulunmuştur. Tanılanmamış diğer 22 bakteri izolatının gelişimlerinin engellenmesi D2an'de %36.4, SCM'de %27.3, mSCM'de %63.6 ve KBT'de %9.1 olarak saptanmıştır. Cmm'in görünebilir kolonileri KBT ve NDA'da 3 günde, D2an'de 4 günde, mSCM'de 6 günde ve SCM'de 9 günde meydana gelmiştir. Ayrıca bazı boyaların (orange g, alizarin red, berberin sulfate, nile blue, eosine g, thionin, methyle orange, kresol rot ve crystal violet) Cmm'in ve tanılanmamış bakteri izolatlarının gelişimini engellemesi ve kolonilerin farklılaşması yönünden etkisi incelenmiştir. Nile blue ve crystal violet, Cmm'i 100 µg/ml konsantrasyonda gelişimini engellemiş ancak boyalardan hiç biri Cmm kolonilerini boyamamıştır