Irak hastanelerinin yakınındaki klinik ve farklı bölgelerden izole edilen Enterobacteriaceae'lerde antibiyotik direnç genlerinin tespiti

Enterobacteriaceae saf izolatlarını elde etmek, antibiyotiklere duyarlılığı değerlendirmek ve direnç genlerini belirlemek için Bağdat ilindeki birden fazla laboratuvardan 80 klinik izolat ve Dicle Nehri yakınlarından 54 çevresel izolat olmak üzere toplam 134 klinik izolat toplandı. Numuneler, Kasım 2021'den Nisan 2022'ye kadar 6 ay boyunca toplandı ve incelendi. Her izolat, morfolojik ve biyokimyasal sistem doğrulama testleri ve VITEK-2 kullanılarak tanımlandı. Çevresel sonuçlar Escherichia coli %44,44, Klebsiella pneumoniae %31,48, Proteus mirabilis %7,40, Citrobacter freundii %1,85, Citrobacter koseri %1,85, Enterobacter aerogenes %12,96 gösterirken, klinik sonuçlar E. coli %33, K. pneumoniae %28, P. mirabilis %19 olarak bulundu. Antibiyotik duyarlılık testi sonuçları, klinik 47 izolatta Penisilin, Amoksisilin, Sefaleksin, Seftazidim ve Tetrasiklin'e %100 ve sırasıyla Amoksisilin-klavulanik asit %80,85, Cefotaksim %65,95, Cefixime 59,57, Sefoksitin %57,44, Aztreonam %61,7 oranında dirençli olduğunu göstermiştir. Tüm izolatlar Meropenem'e %10,6 ve Impenem'e ise %14,89 oranında duyarlılık göstermiştir. Öte yandan, çevresel 22 izolat için yapılan antibiyotik duyarlılık testi sonuçlarında Penisilin, Amoksisilin, Sefaleksin, Seftazidim ve Tetrasiklin'e %100, Amoksisilin-klavulanik asit %77,27, Cefotaksim %77,2, Cefixime %63,63, Sefoksitin %59,09, Aztreonam'a %54,5 oranında dirençli olduğunu ortaya çıkmıştır. Tüm izolatlar Meropenem'e %18,18 oranında duyarlı iken, bu oran Impenem için %13.6 olarak bulunmuştur. DNA dizisinin PCR ile replikasyonu, Enterobacteriaceae'nin 69 klinik ve çevresel izolatı için gerçekleştirilmiştir. Sonuçlar, çevresel izolatlar için tüm izolatların %40,47 oranında blaTEM ve blaSHV geni içerdiğini göstermiştir. 47 klinik izolatta (blaTEM) gen oranı %85,10 ve blaSHV %82,97 iken, sonuçlar E. coli'nin blaTEM genini 15 (%31,91), K. pneumoniae'nin 14 (%29,78) ve P. mirabilis'in 11 (%23,40) şeklinde içerdiğini göstermiştir. blaSHV E. coli için 14 (%29.78), K. pneumonia 14 (%29.78) ve P. mirabilis 11 (%23.40) olarak tespit edilmiştir. Bulgulara göre, klinik izolatlar çevresel izolatlardan daha büyük bir virülans faktörüne sahiptir. Bunun nedeni, çevresel izolatlardan daha yüksek oranlarda direnç genlerine (blaTEM ve blaSHV) sahip olmalarıdır.