Farklı toprak örneklerınde bıyoteknolojık önemı olan mıkroorganızmaların araştırılması

Çalışmamızda Türkiye-Eskişehir bahçe toprağı, Türkiye-Trabzon tarla toprağı, Yemen-İbb tarla toprağı, Ürdün-Amman bahçe toprağı, petrol sahaları olmak üzere 6 farklı toprak örneğinde biyoteknolojik öneme sahip mikroorganizmaların araştırılması amaçlanmıştır. Cezayir-Hassi Messaoud'dan ve Cezayir-Ain Salah'tan gazlı toprak. Örneklerden bakterilerin inkübasyon süresinin uzatılması araştırılmış ve uzamış periyotlarda üreyen bakteriler de diğerleriyle izole edilmiştir. Bireysel ilgi gören bakteriler izole edildi ve morfolojik ve enzimatik testlere tutuldu. Öte yandan bazı mikroorganizma grupları (azotu fiksasyon eden, enerji kaynağı olarak sitratı kullanan, aktinomisetler ve Gram pozitif spor oluşturan) bakteriler hem tanımlanmiş hem de izole edilmiştir. Bakteri DNA Ekstraksiyonu, enzimatik testlerde pozitif çıkan Bakterilerin jel elektroforezi yöntemi kullanılarak yapıldı. Enzimatik testler (Amilaz, Lipaz, Proteinaz ve DNaz Üretimi) enzimleri belirlendi. Çalışmamızda bağımsız yöntemler kapsamında bakterilerin tanımlanması için DNA ekstraksiyonu, 16s rRNA ve Denatüre edici Gradient Jel Elektroforezi DGGE analizi (Amplifiye Edilmiş Ribozomal DNA Restriksiyon Analizi (ARDRA) yöntemi ile yapılmıştır. Bunun yanı sıra Biolog Eco-Plates kullanılarak Topluluk Düzeyinde Fizyolojik Profillerin Taranması ve ayrıca bakteri tanımlama testi yapan tam otomatik sistem olarak VITEK 2 kullanılmıştır.